RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 CD96P40200 585 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SERPINB4P48594 390 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 NAGLUP54802 743 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 BTN3A2P78410 334 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TUBA3CQ13748 450 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 RUNX2Q13950 521 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF766Q5HY98 468 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SPINK14Q6IE38 97 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 LGI4Q8N135 537 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC5A8Q8N695 610 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 MDS2Q8NDY4 140 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CCT6BQ92526 530 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 REPS1Q96D71 796 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 FAR2Q96K12 515 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SCYL1Q96KG9 808 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 FCRL1Q96LA6 429 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNC2Q96PR1 638 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CDK15Q96Q40 435 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SMC6Q96SB8 1091 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 LYRM4Q9HD34 91 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ABI3Q9P2A4 366 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 DAPP1Q9UN19 280 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CACNA1CQ13936 2221 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ITPR2Q14571 2701 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A088AWK7 358 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A1B0GUH1 482 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 GABRR3A8MPY1 467 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 A8MUA0 341 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 MANBAO00462 879 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CDK2AP1O14519 115 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR37O15354 613 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 B3GALT2O43825 422 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SUPT7LO94864 414 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 OR4F21O95013 312 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 UNC5CO95185 931 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ZWINTO95229 277 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 MYZAPP0CAP1 466 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 MST1P26927 711 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 COL8A1P27658 744 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 HTR6P50406 440 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CCNG1P51959 295 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 PLA2G16P53816 162 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 MTTPP55157 894 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 FOXA1P55317 472 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 PER3P56645 1201 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 HSD17B7P56937 341 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 RAB38P57729 211 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNK10P57789 538 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TAS2R50P59544 299 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 PMP22Q01453 160 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 KIAA0040Q15053 153 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TERF2Q15554 542 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 OR1C1Q15619 314 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TTMPQ5BVD1 217 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 XKR7Q5GH72 579 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 KANK2Q63ZY3 851 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 GFRALQ6UXV0 394 aa6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms