RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533683.6

SAMD1-202, Transcript of sterile alpha motif domain containing 1, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD1, Length 2,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1-202ENST00000533683 SERHL2Q9H4I8 314 aa26.95■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 SH3GLB1Q9Y371 365 aa26.95■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 C5orf58C9J3I9 102 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 EPHA2P29317 976 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 KEAP1Q14145 624 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 DUSP7Q16829 419 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 TRIM73Q86UV7 250 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 TMEM19Q96HH6 336 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 BBS4Q96RK4 519 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 GUCY1B2O75343 617 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 AIFM1O95831 613 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 ITGA2P17301 1181 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 GPC1P35052 558 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 KIR2DS3Q14952 304 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 MAPK11Q15759 364 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 BROXQ5VW32 411 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 C18orf63Q68DL7 685 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 KCT2Q8NC54 265 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 MPP4Q96JB8 637 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 OR2A14Q96R47 310 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 TWSG1Q9GZX9 223 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 VCX3AQ9NNX9 186 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 CYP8B1Q9UNU6 501 aa26.94■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa26.93■■□□□ 1.9
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SAMD1-202ENST00000533683 NTSP30990 170 aa26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 TSFMP43897 325 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 RABIFP47224 123 aa26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 IL5RAQ01344 420 aa26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 CDK5R2Q13319 367 aa26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 GPR18Q14330 331 aa26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 RAB39AQ14964 217 aa26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 NEDD8Q15843 81 aa26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 FRMD1Q8N878 549 aa26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 CCDC88CQ9P219 2028 aa26.93■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 J3KTA2 159 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 RECKO95980 971 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 RPS6KA3P51812 740 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 SPIBQ01892 262 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 FBXO42Q6P3S6 717 aa26.92■■□□□ 1.9
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SAMD1-202ENST00000533683 SETD9Q8NE22 299 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 OR4C15Q8NGM1 316 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 OR52J3Q8NH60 311 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 CNIH3Q8TBE1 160 aa26.92■■□□□ 1.9
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SAMD1-202ENST00000533683 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
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SAMD1-202ENST00000533683 IGLV3-19P01714 112 aa26.92■■□□□ 1.9
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SAMD1-202ENST00000533683 CDH12P55289 794 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
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SAMD1-202ENST00000533683 SZRD1Q7Z422 152 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 CXorf21Q9HAI6 301 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 CES1P1Q9UKY3 287 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 BLOC1S6Q9UL45 172 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 GMPPBQ9Y5P6 360 aa26.92■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 OR2A25A4D2G3 310 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 SLC1A7O00341 560 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 ABCB7O75027 752 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 DNAJB5O75953 348 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 CPNE6O95741 557 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 TNFP01375 233 aa26.91■■□□□ 1.9
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SAMD1-202ENST00000533683 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 SUN3Q8TAQ9 357 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 MSANTD3Q96H12 275 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 FEVQ99581 238 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
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SAMD1-202ENST00000533683 PROM1O43490 865 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 CCR5P51681 352 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 GABARAPL2P60520 117 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 BTN3A2P78410 334 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 DUSP2Q05923 314 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 NPRL3Q12980 569 aa26.91■■□□□ 1.9
SAMD1-202ENST00000533683 ASPGQ86U10 573 aa26.91■■□□□ 1.9
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