RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516224.1

RNU6-311P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 311, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-311P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-311P-201ENST00000516224 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GBP6Q6ZN66 633 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 HOOK3Q86VS8 718 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 C17orf64Q86WR6 236 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 WDR49Q8IV35 697 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 OR8H3Q8N146 312 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GANCQ8TET4 914 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 SERAC1Q96JX3 654 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZBP1Q9H171 429 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 CUTCQ9NTM9 273 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 FBXL5Q9UKA1 691 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 CHUKO15111 745 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 KIAA0513O60268 411 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GPX3P22352 226 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GABPAQ06546 454 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 FHL5Q5TD97 284 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 LRRC38Q5VT99 294 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 LIPJQ5W064 366 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 OTOAQ7RTW8 1153 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ASPGQ86U10 573 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 NAXDQ8IW45 347 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 TCP11Q8WWU5 503 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GGHQ92820 318 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 PNPLA2Q96AD5 504 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF350Q9GZX5 532 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GTF3C4Q9UKN8 822 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF487B1APH4 448 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 UMPSP11172 480 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 CHRNA3P32297 505 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ALDH3B1P43353 468 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 IST1P53990 364 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 NDPQ00604 133 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 CCDC158Q5M9N0 1113 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 TRPV3Q8NET8 790 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 BEST4Q8NFU0 473 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 TEKT1Q969V4 418 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ESAMQ96AP7 390 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 PANX3Q96QZ0 392 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 S1PR3Q99500 378 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 WWP1Q9H0M0 922 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 CELA1Q9UNI1 258 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 A4D1N5 150 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 TTI1O43156 1089 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 EPOP01588 193 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GLULP15104 373 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 BRCC3P46736 316 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ST8SIA6P61647 398 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ABRAXAS2Q15018 415 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 OR1C1Q15619 314 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 WSCD2Q2TBF2 565 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 DCAF12Q5T6F0 453 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ITIH5Q86UX2 942 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 LAX1Q8IWV1 398 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 NUP93Q8N1F7 819 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 OR4F5Q8NH21 305 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GOLGA5Q8TBA6 731 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GTSF1Q8WW33 167 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ULK4Q96C45 1275 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 AGPAT1Q99943 283 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 Q9UF83 564 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 SH3PXD2BA1X283 911 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 FAM149AA5PLN7 773 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms