RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516016.1

RN7SKP19-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 19, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP19, Length 252 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP19-201ENST00000516016 NUP107P57740 925 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 CNTN1Q12860 1018 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 GGTLC2Q14390 218 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 IRF3Q14653 427 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 MAPK11Q15759 364 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 PTGISQ16647 500 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 CBWD6Q4V339 395 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF311Q5JNZ3 666 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 CBWD3Q5JTY5 395 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC27A4Q6P1M0 643 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 NLRP14Q86W24 1093 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 TTC5Q8N0Z6 440 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 CADM2Q8N3J6 435 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 CRYGNQ8WXF5 182 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 RFFLQ8WZ73 363 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 SMPDL3AQ92484 453 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 PYCR2Q96C36 320 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 CPNE1Q99829 537 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 OSBPL11Q9BXB4 747 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 ULBP2Q9BZM5 246 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 DPEP3Q9H4B8 488 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 GLIPR2Q9H4G4 154 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 TBX21Q9UL17 535 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 SH3GLB1Q9Y371 365 aa0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 MUC2Q02817 5179 aa0.09□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
RN7SKP19-201ENST00000516016 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 A0A096LNJ9 63 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 LRRD1A4D1F6 860 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 A6NDX4 124 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 B4DLN1 442 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TRIM77I1YAP6 450 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IMPA2O14732 288 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 RIPK2O43353 540 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MMP1P03956 469 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 RETP07949 1114 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 STAG3L1P0CL83 205 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ARL3P36405 182 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 GARSP41250 739 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ARHGDIBP52566 201 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TIMM10P62072 90 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MADCAM1Q13477 382 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 BECN1Q14457 450 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SNAPC1Q16533 368 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TAF9Q16594 264 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF542PQ5EBM4 170 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SUSD4Q5VX71 490 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ELMOD1Q8N336 334 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC43A2Q8N370 569 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 Q8N9W7 124 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IL17REQ8NFR9 667 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR10H4Q8NGA5 316 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 USP6NLQ92738 828 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 RDH5Q92781 318 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NICN1Q9BSH3 213 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ITPAQ9BY32 194 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 UBA5Q9GZZ9 404 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 Q9H3A6 140 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IL1RL2Q9HB29 575 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IRAK4Q9NWZ3 460 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 RAI14Q9P0K7 980 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 OPN4Q9UHM6 478 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC24A2Q9UI40 661 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SCML2Q9UQR0 700 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 KAT6BQ8WYB5 2073 aa0.09□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 FBN2P35556 2912 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 LOC100509620A0A075B734 347 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF878C9JN71 531 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 E5RGE8 158 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 G3V3Y1 287 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 WWP2O00308 870 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PSMD3O43242 534 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 BBOX1O75936 387 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC2A10O95528 541 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 RNH1P13489 461 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ACP1P24666 158 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 UGT1A3P35503 534 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CTRLP40313 264 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NRIP1P48552 1158 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CCT5P48643 541 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 LIG4P49917 911 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 LHX2P50458 406 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MFAP2P55001 183 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 KRTAP12-1P59990 96 aa0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms