RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 NDOR1Q9UHB4 597 aa25.74■■□□□ 1.71
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SH3BP2-221ENST00000511747 TRAPPC4Q9Y296 219 aa25.74■■□□□ 1.71
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SH3BP2-221ENST00000511747 FAAHO00519 579 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2-221ENST00000511747 B4GALT2O60909 372 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2-221ENST00000511747 PPM1AP35813 382 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2-221ENST00000511747 HSPB3Q12988 150 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2-221ENST00000511747 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.73e-6■■■■□ 20.9
SH3BP2-221ENST00000511747 RAET1GQ6H3X3 334 aa25.7■■□□□ 1.7
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