RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 YPEL5P62699 121 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HBA1P69905 142 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 COX20Q5RI15 118 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CPZQ66K79 652 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HORMAD1Q86X24 394 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PLD3Q8IV08 490 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PARP8Q8N3A8 854 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR2T29Q8NH02 315 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C3orf18Q9UK00 162 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MID1O15344 667 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ATE1O95260 518 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SERPIND1P05546 499 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IGFBP5P24593 272 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR1E2P47887 323 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SOX9P48436 509 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HLCSP50747 726 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PNLIPRP1P54315 467 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BNIP3Q12983 259 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RAPSNQ13702 412 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SERPINA11Q86U17 422 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 AMZ2Q86W34 360 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SVOPLQ8N434 492 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GANCQ8TET4 914 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NEK6Q9HC98 313 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C5AR2Q9P296 337 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TAC3Q9UHF0 121 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FEZF1A0PJY2 475 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRMT3O60678 531 aa6.67□□□□□ -1.34
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HERC4-211ENST00000492996 FMO3P31513 532 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ASMTP46597 345 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ALDH9A1P49189 494 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RAD23AP54725 363 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SPIN4Q56A73 249 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FGD3Q5JSP0 725 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ADCK2Q7Z695 626 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR52J3Q8NH60 311 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 UBE2FQ969M7 185 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HHIPQ96QV1 700 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RASSF1Q9NS23 344 aa6.67□□□□□ -1.34
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HERC4-211ENST00000492996 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BCKDKO14874 412 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 VEGFDO43915 354 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MFN2O95140 757 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ITGB2P05107 769 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MATN1P21941 496 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CRHBPP24387 322 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DAPP51397 102 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ARHGDIAP52565 204 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SEC13P55735 322 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RGNQ15493 299 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.66□□□□□ -1.34
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