RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 STARD5Q9NSY2 213 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 A0A0A6YYD5 115 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 HYKKA2RU49 373 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 KRT87PA6NCN2 255 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PLPP1O14494 284 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RFXANKO14593 260 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 EFSO43281 561 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SUV39H1O43463 412 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PROM1O43490 865 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ANP32DO95626 131 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 KRT75O95678 551 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CYC1P08574 325 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 FURINP09958 794 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CPOXP36551 454 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 MAPK10P53779 464 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PLA2G16P53816 162 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TAS2R50P59544 299 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PSME3P61289 254 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 BTN3A2P78410 334 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 KLC1Q07866 573 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 BNIP2Q12982 314 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RIPK1Q13546 671 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PDE7AQ13946 482 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SPIDRQ14159 915 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 IL11RAQ14626 422 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 REP15Q6BDI9 236 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RINLQ6ZS11 566 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SPRED1Q7Z699 444 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 FAM47BQ8NA70 645 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC115Q96NT0 180 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TGM7Q96PF1 710 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TSSK3Q96PN8 268 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CDRT15Q96T59 188 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 HBEGFQ99075 208 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ECSITQ9BQ95 431 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ZPBPQ9BS86 351 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TRIM15Q9C019 465 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 MAP10Q9P2G4 905 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 VPS4AQ9UN37 437 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 COL12A1Q99715 3063 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 A0A1W2PRB8 838 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TTC36A6NLP5 189 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NR5A2O00482 541 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PCDH17O14917 1159 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PLD2O14939 933 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CTSVO60911 334 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ETHE1O95571 254 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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