RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SPACA6	W5XKT8	324 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF682	O95780	498 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	LDLR	P01130	860 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CFI	P05156	583 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ARAF	P10398	606 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	BMP2	P12643	396 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MYF5	P13349	255 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	KDELR2	P33947	212 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PRIM2	P49643	509 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	DUSP2	Q05923	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	RBBP4	Q09028	425 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SCARB2	Q14108	478 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NR1D2	Q14995	579 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CEBPE	Q15744	281 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NKG7	Q16617	165 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM64	Q6YI46	380 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SZRD1	Q7Z422	152 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GALNT10	Q86SR1	603 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SFXN5	Q8TD22	340 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	C10orf90	Q96M02	699 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHL3	Q9UH77	587 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIO	O75962	3097 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PS29	197 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	YKT6	O15498	198 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	DNAJB6	O75190	326 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CTSB	P07858	339 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ALPPL2	P10696	532 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	AQP1	P29972	269 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CSF2RB	P32927	897 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PTGER1	P34995	402 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR3	P46089	330 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GABRA4	P48169	554 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CCT8	P50990	548 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GPLD1	P80108	840 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SHC2	P98077	582 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CDK6	Q00534	326 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NDUFA9	Q16795	377 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	HLA-B	Q31612	363 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CBLL1	Q75N03	491 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PYURF	Q96I23	114 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	VPS50	Q96JG6	964 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF681	Q96N22	645 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CIB1	Q99828	191 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PSME2	Q9UL46	239 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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