RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC16A8O95907 504 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 GSTM1P09488 218 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 PKLRP30613 574 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 GPC1P35052 558 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 GZMKP49863 264 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR5P61964 334 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 FCHO2Q0JRZ9 810 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 TNK1Q13470 666 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 LEXMQ3ZCV2 418 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 PYDC2Q56P42 97 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMKK1Q8N5S9 505 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 ENKURQ8TC29 256 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 DEDD2Q8WXF8 326 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 C11orf16Q9NQ32 467 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 PCM1Q15154 2024 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 HBQ1P09105 142 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC2LP0C7M8 214 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 CPN2P22792 545 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 FEN1P39748 380 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 BDKRB1P46663 353 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 PREPP48147 710 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR19Q15760 415 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC5A12Q1EHB4 618 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 MEDAGQ5VYS4 303 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 TIGD3Q6B0B8 471 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 ASZ1Q8WWH4 475 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 MND1Q9BWT6 205 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 C1GALT1Q9NS00 363 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TLR4O00206 839 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PRRG1O14668 218 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PLD2O14939 933 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN19P0C672 248 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK6Q00534 326 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 NCF4Q15080 339 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SPIN4Q56A73 249 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC28AQ8IWP9 274 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC38A6Q8IZM9 456 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52N2Q8NGI0 321 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB23Q9ULC3 237 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 AKR7A2O43488 359 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 LGI1O95970 557 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 MSL3P1P0C860 447 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD3B1P14060 373 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD3B2P26439 372 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNC3Q14003 757 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 MPEG1Q2M385 716 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 LIPKQ5VXJ0 399 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 NANOGP1Q8N7R0 232 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4M1Q8NGD0 313 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 NEIL2Q969S2 332 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 NIPAL2Q9H841 368 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX11Q9Y5W9 270 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CHD7Q9P2D1 2997 aa17.45■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 FADS2P1A8MWK0 482 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SLCO2B1O94956 709 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 AP2A2O94973 939 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 IL1AP01583 271 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 C1QBP02746 253 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ALAS2P22557 587 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 IMPA1P29218 277 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SSTR4P31391 388 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TATDN3Q17R31 274 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 BTBD16Q32M84 506 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TPGS2Q68CL5 300 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM180BQ6P0A1 224 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TMPRSS11BQ86T26 416 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PHC2Q8IXK0 858 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN22Q8N7P3 220 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 NECTIN4Q96NY8 510 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 DHRS9Q9BPW9 319 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 REEP4Q9H6H4 257 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SPG21Q9NZD8 308 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PPIL1Q9Y3C6 166 aa17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms