RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 RHAGQ02094 409 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 HSPB3Q12988 150 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 HEPACAMQ14CZ8 416 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SSX1Q16384 188 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 MEDAGQ5VYS4 303 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 TMEM53Q6P2H8 277 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 C17orf64Q86WR6 236 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 NATD1Q8N6N6 113 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 OR2L2Q8NH16 312 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 RAB8BQ92930 207 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 OTUB2Q96DC9 234 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 TMEM80Q96HE8 168 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SLC30A2Q9BRI3 323 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 C11orf49Q9H6J7 331 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 DYRK4Q9NR20 520 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SEMA3GQ9NS98 782 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 KLHL3Q9UH77 587 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 DSPPQ9NZW4 1301 aa12.46□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 CTDSP2O14595 271 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 KMOO15229 486 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 RGS5O15539 181 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 MMP20O60882 483 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 COQ9O75208 318 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 GPX5O75715 221 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 MFN2O95140 757 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 CKMT1AP12532 417 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 C6P13671 934 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 CD72P21854 359 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ITGB8P26012 769 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ACADLP28330 430 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 TIE1P35590 1138 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 XKP51811 444 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ILKQ13418 452 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ZNF765Q7L2R6 523 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 GDPD3Q7L5L3 318 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 C6orf120Q7Z4R8 191 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ZNF547Q8IVP9 402 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 GPR32P1Q8NGA4 272 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 OR5AR1Q8NGP9 310 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ZNF607Q96SK3 696 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 CCDC32Q9BV29 185 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 TAPBPLQ9BX59 468 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ASPNQ9BXN1 380 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SMURF1Q9HCE7 757 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SLAMF7Q9NQ25 335 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 A0A075B6Q4 140 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SEMA3DO95025 777 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 CXCR2P25025 360 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SOX3P41225 446 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 EPHA5P54756 1037 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SEC23BQ15437 767 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SLX4IPQ5VYV7 408 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SZRD1Q7Z422 152 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 FAM129CQ86XR2 697 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 OR8H2Q8N162 312 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 FLCNQ8NFG4 579 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 RASSF5Q8WWW0 418 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 ZNF354BQ96LW1 612 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 QRFPRQ96P65 431 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 F2RL3Q96RI0 385 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 AIF1LQ9BQI0 150 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 MND1Q9BWT6 205 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 RACGAP1Q9H0H5 632 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 REV1Q9UBZ9 1251 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SEC14L3Q9UDX4 400 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 TAC3Q9UHF0 121 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 GPR34Q9UPC5 381 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SPINT1O43278 529 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 DYRK3O43781 588 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SLC28A2O43868 658 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 CSO75390 466 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 PAPLNO95428 1278 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 RB1P06400 928 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 CLTBP09497 229 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 CASP3P42574 277 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SMIM11AP58511 58 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 DHCR24Q15392 516 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 SPHARQ15513 63 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 PLPP4Q5VZY2 271 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-201ENST00000398741 TCTN3Q6NUS6 607 aa12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms