RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.57□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RNF112Q9ULX5 631 aa9.57□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SNX24Q9Y343 169 aa9.57□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SPACA6W5XKT8 324 aa9.57□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 APCP25054 2843 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 A0A0G2JNJ9 132 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 OR14I1A6ND48 311 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 E7ESA3 106 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 KLK8O60259 260 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ZWINTO95229 277 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ETHE1O95571 254 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 TGFB1P01137 390 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 IGHG3P01860 377 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 GLI4P10075 376 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 STMN1P16949 149 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 EPORP19235 508 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CPN2P22792 545 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SSTR1P30872 391 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 GGT5P36269 586 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 GMPRP36959 345 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SSR2P43308 183 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ART1P52961 327 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ATP6V0D1P61421 351 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ASPHQ12797 758 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CES4AQ5XG92 561 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 TRILQ7L0X0 811 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PDPRQ8NCN5 879 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 OR8K3Q8NH51 312 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 DOK4Q8TEW6 326 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF721Q8TF20 911 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 NRGNQ92686 78 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CDKL2Q92772 493 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 WDR34Q96EX3 536 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 DGAT2Q96PD7 388 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 KRT12Q99456 494 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 MS4A8Q9BY19 250 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 Q9UFV3 132 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.56□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1B0GVC2 190 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC188H7C350 402 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 AQP7O14520 342 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 TP73O15350 636 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 FGF17O60258 216 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 DIAPH2O60879 1101 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 COX7A2P14406 83 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CD1EP15812 388 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PIGAP37287 484 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SLC10A1Q14973 349 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 WLSQ5T9L3 541 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RTL6Q6ICC9 239 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 MED27Q6P2C8 311 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CREG2Q8IUH2 290 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RNF175Q8N4F7 328 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SARAFQ96BY9 339 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SGCZQ96LD1 299 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 GPR22Q99680 433 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RBBP8Q99708 897 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CD244Q9BZW8 370 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 DPH5Q9H2P9 285 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms