RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SNNO75324 88 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TSPAN9O75954 239 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 OR5F1O95221 314 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SNAPINO95295 136 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PGK2P07205 417 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 RETP07949 1114 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 RPS17P08708 135 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 H2AFZP0C0S5 128 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ACADMP11310 421 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SFTPCP11686 197 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GZMAP12544 262 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PRKACAP17612 351 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PSMC3P17980 439 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ATF6P18850 670 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ITIH1P19827 911 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CD40LGP29965 261 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HOXA6P31267 233 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SHMT1P34896 483 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 AHRP35869 848 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 DDOSTP39656 456 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEA11P43364 429 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CCR10P46092 362 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 OR3A3P47888 321 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NR2C2P49116 596 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ETV1P50549 477 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 AP1S2P56377 157 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PPARDQ03181 441 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TAF5Q15542 800 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TRIP10Q15642 601 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TEX44Q53QW1 395 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SLC10A5Q5PT55 438 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 UGT3A1Q6NUS8 523 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MFSD6Q6ZSS7 791 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 H2AFVQ71UI9 128 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 LINGO2Q7L985 606 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 WDR49Q8IV35 697 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFAF2Q8N183 169 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PARP8Q8N3A8 854 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 S100ZQ8WXG8 99 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA17Q96L03 361 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 AK8Q96MA6 479 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 THTPAQ9BU02 230 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 KIFC1Q9BW19 673 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 OR51B5Q9H339 312 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TRABDQ9H4I3 376 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 UCK1Q9HA47 277 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CXorf21Q9HAI6 301 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SIX2Q9NPC8 291 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TIGARQ9NQ88 270 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 IL37Q9NZH6 218 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MOSPD1Q9UJG1 213 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PADI3Q9ULW8 664 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 AP4S1Q9Y587 144 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CACNG2Q9Y698 323 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 ITGB4P16144 1822 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 DOCK1Q14185 1865 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CITO14578 2027 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CACNA1SQ13698 1873 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 RIC1Q4ADV7 1423 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ROBO3Q96MS0 1386 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEB16A2A368 324 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GOLGA8IPA6NC78 632 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00862A6NCI5 91 aa3.31□□□□□ -1.88
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