RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 GLIPR2Q9H4G4 154 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 C5orf66Q9H5L9 145 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 JMJD4Q9H9V9 463 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL1RL2Q9HB29 575 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D22BQ9NU19 505 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDP2Q9P2J9 529 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPM3Q9P2X0 92 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 GMEB2Q9UKD1 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NSG2Q9Y328 171 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPIAL4AQ9Y536 164 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PARD3Q8TEW0 1356 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF212BA8MTL3 300 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBR2O15453 112 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 AP5Z1O43299 807 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RIPK2O43353 540 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 DEDDO75618 318 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNPP00491 289 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CALCAP01258 141 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3-9P01782 118 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 STAG3L1P0CL83 205 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CT45A10P0DMU9 189 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCNCP24863 283 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTPN4P29074 926 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP2R1AP30153 589 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 HADHAP40939 763 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGDIBP52566 201 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MFAP2P55001 183 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUP107P57740 925 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP12-1P59990 96 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDE7AQ13946 482 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 BECN1Q14457 450 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC17A1Q14916 467 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNAPC1Q16533 368 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CBWD6Q4V339 395 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB41Q5JT25 222 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CBWD3Q5JTY5 395 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACER2Q5QJU3 275 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLPP4Q5VZY2 271 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR52W1Q6IF63 320 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC27A4Q6P1M0 643 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 C17orf107Q6ZR85 190 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 UNC5CLQ8IV45 518 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAMKVQ8NCB2 501 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB44Q8NCP5 570 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2L8Q8NGY9 312 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 C8orf46Q8TAG6 207 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCUN1D4Q92564 292 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 C7orf26Q96N11 449 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FEVQ99581 238 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CARD9Q9H257 536 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPEP2Q9H4A9 486 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPEP3Q9H4B8 488 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRAK4Q9NWZ3 460 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC24A2Q9UI40 661 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBX21Q9UL17 535 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRD1A4D1F6 860 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 A6NDX4 124 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF732B4DXR9 585 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHGR1C9JFL3 82 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC17A2O00624 439 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLDN4O14493 209 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PGRMC2O15173 223 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 P2RX6O15547 441 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSMD3O43242 534 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBED4O75132 1171 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCGB1D1O95968 90 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TIMP1P01033 207 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PENKP01210 267 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 INSP01308 110 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRB1P04280 392 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV4-34P06331 123 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 EEF2P13639 858 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP11B1P15538 503 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADRA2CP18825 462 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV1-2P23083 117 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GABRR1P24046 479 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 UGT1A3P35503 534 aa0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms