RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR137BO60478 399 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CILPO75339 1184 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 UQCRC2P22695 453 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ALDH3B1P43353 468 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LRP8Q14114 963 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DSC3Q14574 896 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNJQ5T5M9 372 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 AWAT2Q6E213 333 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RDH10Q8IZV5 341 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BBS1Q8NFJ9 593 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4K2Q8NGD2 314 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR22Q99680 433 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MROQ9BYG7 248 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 A3GALT2U3KPV4 340 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB4AP20338 218 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEA11P43364 429 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 STK11Q15831 433 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC22A25Q6T423 547 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RADILQ96JH8 1075 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TM6SF2Q9BZW4 377 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FZD4Q9ULV1 537 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 EBLN1P0CF75 366 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 AKR1A1P14550 325 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF30P17039 623 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CNTN2Q02246 1040 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LIPKQ5VXJ0 399 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 IQCHQ86VS3 1027 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BORCS8Q96FH0 119 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PDCD2LQ9BRP1 358 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DEFB129Q9H1M3 183 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TVP23AA6NH52 213 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDH7O60245 1069 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 JRKO75564 520 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB7AO95365 584 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HSD17B1P14061 328 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DCST2Q5T1A1 773 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LCN8Q6JVE9 175 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 JAGN1Q8N5M9 183 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC22A8Q8TCC7 542 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TFAP2CQ92754 450 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ELP4Q96EB1 424 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FCRL5Q96RD9 977 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GSKIPQ9P0R6 139 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 YDJCA8MPS7 323 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MEIS2O14770 477 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 INPPL1O15357 1258 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CD3GP09693 182 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SPIN3Q5JUX0 258 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SUN3Q8TAQ9 357 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ARNTL2Q8WYA1 636 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ASB6Q9NWX5 421 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CACFD1Q9UGQ2 172 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNQ2O43526 872 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TFP02787 698 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 EPHX2P34913 555 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXD13P35453 343 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR143P51810 404 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CASP7P55210 303 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DLX5P56178 289 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OTOP3Q7RTS5 596 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CMIPQ8IY22 773 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 UPRTQ96BW1 309 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR52A5Q9H2C5 316 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TPT1P8Q9HAU6 139 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 EXTL2Q9UBQ6 330 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC7A11Q9UPY5 501 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BHLHE40O14503 412 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NPC1O15118 1278 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HCKP08631 526 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPN2P17706 415 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CPT2P23786 658 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TCEANCQ8N8B7 351 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR6C4Q8NGE1 309 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CLDN5O00501 218 aa10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 367.1 ms