RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CDK20Q8IZL9 346 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PGBD3Q8N328 593 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 S100PBPQ96BU1 408 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TEPSINQ96N21 525 aa15.92■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 KCNJ9Q92806 393 aa15.91■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CD244Q9BZW8 370 aa15.91■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.91■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 MAP2K6P52564 334 aa15.91■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 FRMPD2BQ6IN97 320 aa15.91■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 B3GLCTQ6Y288 498 aa15.91■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PCYT2Q99447 389 aa15.91■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR51V1Q9H2C8 321 aa15.91■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PRDM9Q9NQV7 894 aa15.91■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ASAH2Q9NR71 780 aa15.91■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 TMEM5Q9Y2B1 443 aa15.91■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 SLC2A13Q96QE2 648 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TMEM185BQ9H7F4 350 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 EMC7Q9NPA0 242 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 USP3Q9Y6I4 520 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 A0A1B0GTL3 188 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 A0A1B0GVM2 712 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PDHXO00330 501 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SIX6O95475 246 aa15.9■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 VIPR1P32241 457 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CBLL1Q75N03 491 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CHPFQ8IZ52 775 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SMOQ99835 787 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SLC32A1Q9H598 525 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CATP04040 527 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 PITPNBP48739 271 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 KRT33BQ14525 404 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 IL20RBQ6UXL0 311 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 KLBQ86Z14 1044 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 GPR152Q8TDT2 470 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.9■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.89■□□□□ 0.14
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