RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF101Q8IZC7 436 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RNF121Q9H920 327 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PDE7BQ9NP56 450 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 MEMO1Q9Y316 297 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 WASH4PA8MWX3 477 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 H0YJX3 145 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 MAN2B1O00754 1011 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 GJB3O75712 270 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF432O94892 652 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ARHGEF15O94989 841 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RASAL1O95294 804 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 VIPR2P41587 438 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RAB28P51157 221 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 FOXA1P55317 472 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 IQCF2Q8IXL9 164 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 FAM86B1Q8N7N1 296 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ARRDC2Q8TBH0 407 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ABCA3Q99758 1704 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 A0A1W2PPW3 197 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 OR6C74A6NCV1 312 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 WASHC1A8K0Z3 465 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 WASH3PC4AMC7 463 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 GPR39O43194 453 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 GABBR2O75899 941 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 AK1P00568 194 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 HTR1AP08908 422 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RGRP47804 291 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ST3GAL4Q11206 333 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ADAM15Q13444 863 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D25Q3MII6 688 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 KANK2Q63ZY3 851 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 WASH2PQ6VEQ5 465 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ASB18Q6ZVZ8 466 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 JAGN1Q8N5M9 183 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 OR8J1Q8NGP2 316 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 GPR150Q8NGU9 434 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CEP76Q8TAP6 659 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CITED4Q96RK1 184 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 VILLO15195 856 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 XPNPEP2O43895 674 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PPM1BO75688 479 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CSTAP01040 98 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 OR4D2P58180 307 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PLGLB1Q02325 96 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CES4AQ5XG92 561 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CCRL2O00421 344 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CAPN3P20807 821 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 GABRA3P34903 492 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ERVPABLB-1P60509 514 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PSD4Q8NDX1 1056 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 FBXL8Q96CD0 374 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CMKLR1Q99788 373 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 IL21RQ9HBE5 538 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 DRGXA6NNA5 263 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 FGF4P08620 206 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RPA4Q13156 261 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RCAN2Q14206 197 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 MAGIXQ9H6Y5 334 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 IL26Q9NPH9 171 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ADRB3P13945 408 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RHCEP18577 417 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ALG1LQ6GMV1 187 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 LCN8Q6JVE9 175 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM73Q86UV7 250 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CHST14Q8NCH0 376 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 OR2T33Q8NG76 320 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SLC39A13Q96H72 371 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ZIC5Q96T25 663 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms