RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 SPACA6W5XKT8 324 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 CYR61O00622 381 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PRMT3O60678 531 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 AIFM1O95831 613 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 ZGLP1P0C6A0 271 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 T-ENOLP0DO92 83 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 GPX3P22352 226 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 C21orf58P58505 322 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 NCALDP61601 193 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 C2orf80Q0P641 193 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 HEPACAMQ14CZ8 416 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 C18orf63Q68DL7 685 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 TREML1Q86YW5 311 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 RIMKLAQ8IXN7 391 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 MIER2Q8N344 545 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 OR2Y1Q8NGV0 311 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PEX11GQ96HA9 241 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 CSF3RQ99062 836 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 SPSB2Q99619 263 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 FAIM2Q9BWQ8 316 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 CPNE5Q9HCH3 593 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 ZIM2Q9NZV7 527 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 C1orf226A1L170 272 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 VSTM2BA6NLU5 285 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 LRATO95237 230 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 DRD2P14416 443 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PRPS1L1P21108 318 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 JAK1P23458 1154 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 NME5P56597 212 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 FOXL2P58012 376 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 UFM1P61960 85 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 KLF10Q13118 480 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 MFSD4BQ5TF39 518 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 FAM69BQ5VUD6 431 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 MED25Q71SY5 747 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 RBCK1Q9BYM8 510 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 DPY30Q9C005 99 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 MAPRE3Q9UPY8 281 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 BMP10O95393 424 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 NR2F6P10588 404 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PRKAR1AP10644 381 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 DDCP20711 480 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 IL10P22301 178 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 CORO7P57737 925 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 ERV3-1Q14264 604 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PAOXQ6QHF9 649 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 MMP21Q8N119 569 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 FAM47BQ8NA70 645 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D20Q96BZ9 403 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 KLHL29Q96CT2 875 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 TEX37Q96LM6 180 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 OR1F2PQ96R84 312 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 CRB3Q9BUF7 120 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 TGIF2Q9GZN2 237 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 REEP4Q9H6H4 257 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PRDM9Q9NQV7 894 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM45AQ9NWC5 275 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 CDC14CA4D256 554 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 FAM227AF5H4B4 570 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 AKAP10O43572 662 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 SLC22A3O75751 556 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 FURINP09958 794 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 HPCAL1P37235 193 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 CXADRP78310 365 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 VAC14Q08AM6 782 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 IL10RAQ13651 578 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 PDE7AQ13946 482 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 MINDY4Q4G0A6 757 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 RAB43Q86YS6 212 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM52Q8NDY8 209 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 OR9I1Q8NGQ6 314 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 UCN3Q969E3 161 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 MTERF3Q96E29 417 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 LRMDAQ9H2I8 198 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 WDR41Q9HAD4 459 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 EHD3Q9NZN3 535 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 ATP6V1HQ9UI12 483 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 C3orf18Q9UK00 162 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD11-201ENST00000249504 BLACEA4D250 179 aa18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms