RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220325.8

EHD4-201, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD4, Length 6,416 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-201ENST00000220325 STK11Q15831 433 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 NCEH1Q6PIU2 408 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 FAM86B1Q8N7N1 296 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 HUS1BQ8NHY5 278 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 SEC14L1Q92503 715 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 SMIM14Q96QK8 99 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 GNRHRP30968 328 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 HERV-K104P61576 105 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 OR5AR1Q8NGP9 310 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 CNIH3Q8TBE1 160 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 GLS2Q9UI32 602 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 SH2B3Q9UQQ2 575 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 MAN2B1O00754 1011 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 TIMP1P01033 207 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 CLECL1Q8IZS7 167 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 HAPLN2Q9GZV7 340 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 ENY2Q9NPA8 101 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 HEBP1Q9NRV9 189 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 CLEC4EQ9ULY5 219 aa13.6□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 PLOD2O00469 737 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 CDKN3Q16667 212 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 UBE2UQ5VVX9 321 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 FIGLAQ6QHK4 219 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 SHFQ7M4L6 423 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 LAS2Q8IYD9 372 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 SLC6A7Q99884 636 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 METTL21EPA6NDL7 271 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 TSPAN4O14817 238 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 CD97P48960 835 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 SLC26A5P58743 744 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 ATAD3CQ5T2N8 411 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 PITX2Q99697 317 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 NANOGQ9H9S0 305 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 REV1Q9UBZ9 1251 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 VDAC3Q9Y277 283 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 H3BSA7 217 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 IFNA21P01568 189 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 RNH1P13489 461 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 ZNF35P13682 527 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 CD1DP15813 335 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 PIK3CBP42338 1070 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 DEFA5Q01523 94 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 TRAM2Q15035 370 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 PRR18Q8N4B5 295 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 KNL1Q8NG31 2342 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 AQP12BA6NM10 295 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 GPR39O43194 453 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 CBFA2T3O75081 653 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 BCKDHAP12694 445 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 OR5M10Q6IEU7 315 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 Q6ZSR6 202 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 ZNF227Q86WZ6 799 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 AQP12AQ8IXF9 295 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 CCDC36Q8IYA8 594 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 DENND1AQ8TEH3 1009 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 TIGARQ9NQ88 270 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 PRODH2Q9UF12 536 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 P04436 131 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 OXTRP30559 389 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 DSC1Q08554 894 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 SQSTM1Q13501 440 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 GRIN2CQ14957 1233 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 CDK10Q15131 360 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 TMEFF1Q8IYR6 380 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 TAMM41Q96BW9 452 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 C1orf74Q96LT6 269 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 MAP3K3Q99759 626 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 MND1Q9BWT6 205 aa13.59□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa13.58□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 SMCO3A2RU48 225 aa13.58□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 NPIPA7E9PJI5 369 aa13.58□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 NPIPA8P0DM63 369 aa13.58□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 ABHD18Q0P651 414 aa13.58□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 SLC36A3Q495N2 470 aa13.58□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 LIPKQ5VXJ0 399 aa13.58□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 XKRXQ6PP77 449 aa13.58□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 TMEM59LQ9UK28 342 aa13.58□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
EHD4-201ENST00000220325 F10P00742 488 aa13.58□□□□□ -0.24
EHD4-201ENST00000220325 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
EHD4-201ENST00000220325 UQCRC2P22695 453 aa13.58□□□□□ -0.24
EHD4-201ENST00000220325 OR4D1Q15615 310 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms