RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr850Q8VFF2 315 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr649Q8VGW1 312 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nphs2Q91X05 385 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrch4Q921G6 680 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssr2Q9CPW5 183 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CsQ9CZU6 464 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agpat5Q9D1E8 365 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chp2Q9D869 196 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtf2e2Q9D902 292 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ap2b1Q9DBG3 937 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pycr3Q9DCC4 274 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zc3h8Q9JJ48 305 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2afyQ9QZQ8 372 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DmtnQ9WV69 405 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GghQ9Z0L8 317 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crlf3Q9Z2L7 442 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm29554A0A087WNW4 188 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rps2-ps6A0A140T8L5 221 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prrt4B2RU40 902 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6034E9Q101 117 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp760E9QAF5 666 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm340F6RGI3 1242 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm19684G3UZ45 117 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr618K7N6B3 318 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r102L7N279 857 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dscr3O35075 297 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prl4a1O35256 227 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FkbplO35450 347 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rad51dO55230 329 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Htr3aP23979 487 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsd3b1P24815 373 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TesP47226 423 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Inpp1P49442 396 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nup43P59235 380 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbp2P70695 339 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aars2Q14CH7 980 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930512M02RikQ5SQK8 218 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myo1dQ5SYD0 1006 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Birc2Q62210 612 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stmnd1Q6P3A1 279 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PdprQ7TSQ8 878 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim36Q80WG7 729 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mppe1Q80XL7 396 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam83eQ80XS7 481 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atg4dQ8BGV9 474 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chst8Q8BQ86 417 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pomgnt2Q8BW41 605 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn17Q8BXA6 224 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eri3Q8C460 337 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apoa5Q8C7G5 368 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl2Q8JZP3 593 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acer2Q8VD53 275 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf24Q91VN1 368 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep97Q9CZ62 856 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4933436I01RikQ9D3T1 429 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pbld1Q9DCG6 288 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc30a7Q9JKN1 378 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prl3c1Q9QUN5 212 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plod2Q9R0B9 737 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam11Q9R1V4 773 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rgs11Q9Z2H1 443 aa10.45□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm35060A0A140LIV7 231 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MiipA2A7Y5 387 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tyw5A2RSX7 315 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700084M14RikB1AT01 78 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam84bD3YXJ5 310 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6502L7N456 481 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnk1O08581 336 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rem1O35929 297 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nipsnap2O55126 281 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtnd2P03893 345 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klk1b11P15946 261 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pax4P32115 349 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csn1s2aQ02862 184 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl17Q3U2U7 461 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pou4f2Q63934 411 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lefty1Q64280 368 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pptc7Q6NVE9 310 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxo30Q8BJL1 746 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lpar4Q8BLG2 370 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RhbgQ8BUX5 455 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt2a3Q8BWQ1 534 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clptm1lQ8BXA5 539 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bend5Q8C6D4 421 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5111Q8C9M4 190 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pih1d2Q8CHR9 315 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr1Q8K087 353 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zg16Q8K0C5 167 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rfc3Q8R323 356 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr350Q8VFP8 312 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr48Q8VGN4 301 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26 ms