RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc126Q8BIS8 140 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Derl2Q8BNI4 239 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kiaa1671Q8BRV5 308 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 IlvblQ8BU33 632 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx16Q8C080 344 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zhx3Q8C0Q2 951 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dppa4Q8CCG4 296 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AcppQ8CE08 381 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2afjQ8R1M2 129 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acot7Q91V12 381 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tex13bQ99MW5 186 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ift46Q9DB07 301 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr53Q9DB94 358 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pdzk1Q9JIL4 519 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1508Q9R0K4 310 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PfkpQ9WUA3 784 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ReckQ9Z0J1 971 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpinb9eO08806 377 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tk1P04184 233 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hsf2P38533 535 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gbx2P48031 348 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rps26P62855 115 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr2lP62876 67 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr681Q3SXH8 315 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Casd1Q7TN73 797 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Palm2Q8BR92 376 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr679Q8VGV0 315 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhga6Q91XY2 932 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Desi1Q9CQT7 168 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4930578G10RikQ9D4Q4 153 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Capn10Q9ESK3 666 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B4galt6Q9WVK5 382 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RerglB2RVE2 204 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem265E9Q8G3 109 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smim18J3QNP2 93 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Alox12P39655 663 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl6P47911 296 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BckdhaP50136 442 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm14226Q3TZL0 686 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbbp4Q60972 425 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AktipQ64362 292 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BC080695Q66JY9 481 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 WdcpQ6NV72 663 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bfsp2Q6NVD9 416 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AardQ811W1 167 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CtsoQ8BM88 312 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MaobQ8BW75 520 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ExogQ8C163 368 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plekhn1Q8C886 359 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr315Q8VFG7 309 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atg13Q91YI1 516 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cadm3Q99N28 396 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx20Q9D2Y5 313 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp5dQ9D3D9 168 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm15013V9GWY0 266 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lcn5A2AJB7 192 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 L3mbtl4B1B1A0 621 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FesP16879 822 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Crybb2P62696 205 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hyal4Q05A56 481 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MlanaQ2TA50 113 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcg1Q64343 666 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oog2Q7TPX8 476 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zik1Q80YP6 463 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hyal5Q812F3 526 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itih5Q8BJD1 952 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wfikkn1Q8R0S6 552 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NoboxQ8VIH1 527 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Camk2gQ923T9 529 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr146Q99LE2 333 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spg21Q9CQC8 308 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mospd2Q9CWP6 518 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem269Q9D4Y8 254 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tet2Q4JK59 1912 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp808B8JJZ4 753 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4930444G20RikD3Z741 495 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Htr3aP23979 487 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Alg10bQ3UGP8 474 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eef2kmtQ3UZW7 335 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr165Q3V3A3 455 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr765Q7TRI6 309 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psmd11Q8BG32 422 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf750Q8BH05 703 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cnksr3Q8BMA3 555 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr767Q8VG33 309 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam3cQ91VU0 227 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx11Q91WL6 271 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd209aQ91ZX1 238 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TympQ99N42 471 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tex19.2Q9D5S1 317 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hspb11Q9D6H2 143 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tor1aQ9ER39 333 aa16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.2 ms