RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	CTBP2	P56545	445 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	SH3BP2	P78314	561 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	GPR142	Q7Z601	462 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	KLB	Q86Z14	1044 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	SMCO3	A2RU48	225 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	HMX3	A6NHT5	357 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CYB5A	P00167	134 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	PAH	P00439	452 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF20	P17024	532 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	NELL2	Q99435	816 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CAPN14	A8MX76	684 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	EPHX1	P07099	455 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ADH1A	P07327	375 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	SFTPB	P07988	381 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	MMP3	P08254	477 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ALPPL2	P10696	532 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	OXTR	P30559	389 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	PRKX	P51817	358 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	TAS2R43	P59537	309 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	POU4F3	Q15319	338 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	OR51A7	Q8NH64	312 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ASB15	Q8WXK1	588 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF599	Q96NL3	588 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	MCHR1	Q99705	422 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CD244	Q9BZW8	370 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF39	Q9H2S5	420 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	SIX4	Q9UIU6	781 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A096LPI6	279 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	KMO	O15229	486 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	EED	O75530	441 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	PCCB	P05166	539 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	KEL	P23276	732 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CDKN2C	P42773	168 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	OSTF1	Q92882	214 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	BCO2	Q9BYV7	579 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CIT	O14578	2027 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	COL1A2	P08123	1366 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	WNT9A	O14904	365 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	GRID2	O43424	1007 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDHGA12	O60330	932 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	UBXN7	O94888	489 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	TRAM2	Q15035	370 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	RAD9A	Q99638	391 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	IGFLR1	Q9H665	355 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362		F8W036	122 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM72C	H0Y354	149 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	BEST1	O76090	585 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	SPDEF	O95238	335 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM200B-223	ENST00000622362	PRNP	P04156	253 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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