RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-240ENST00000613995 EPORP19235 508 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 CD22P20273 847 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 NR1D1P20393 614 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 AHRP35869 848 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 XCR1P46094 333 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 PIK3CGP48736 1102 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 EMP2P54851 167 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 OLR1P78380 273 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 KLC1Q07866 573 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 NFATC3Q12968 1075 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 KCNAB2Q13303 367 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 RAPSNQ13702 412 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 GTF2H2Q13888 395 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 FAM53BQ14153 422 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 SSPNQ14714 243 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 HERC3Q15034 1050 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 RBBP7Q16576 425 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 PAGE2BQ5JRK9 111 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 TIFABQ6ZNK6 161 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ABHD13Q7L211 337 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 PDSS2Q86YH6 399 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 AMER3Q8N944 861 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRPV3Q8NET8 790 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 OR5T3Q8NGG3 340 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 OR51Q1Q8NH59 317 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 UBTD2Q8WUN7 234 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 THAP4Q8WY91 577 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZBTB9Q96C00 473 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 C8orf44Q96CB5 159 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 MVB12AQ96EY5 273 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 PEX11GQ96HA9 241 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 F2RL3Q96RI0 385 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 EFCAB11Q9BUY7 163 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 PARD6BQ9BYG5 372 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ING2Q9H160 280 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 RHBGQ9H310 441 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 EHD1Q9H4M9 534 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 IPPKQ9H8X2 491 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 WDR54Q9H977 334 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ACTR8Q9H981 624 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ACSS2Q9NR19 701 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 P4HTMQ9NXG6 502 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 TMEM216Q9P0N5 145 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 FETUBQ9UGM5 382 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 C3orf18Q9UK00 162 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 POLEQ07864 2286 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 BSNQ9UPA5 3926 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 A0A1W2PRQ8 180 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 LRIT2A6NDA9 550 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 URADA6NGE7 173 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 VGLL3A8MV65 326 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 IDSB3KWA1 339 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 C4orf51C9J302 202 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 H0YIG0 161 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 MKRN2OSH3BPM6 223 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 K7EM74 188 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 AGPSO00116 658 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 E2F3O00716 465 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 ERI3O43414 337 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 CHST10O43529 356 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 KLK8O60259 260 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240ENST00000613995 B4GALT2O60909 372 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms