RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF721Q8TF20 911 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA1191Q96A73 305 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SARAFQ96BY9 339 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 LDAHQ9H6V9 325 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 LYRM4Q9HD34 91 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC11Q9NVH1 559 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF358Q9NW07 568 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CES2O00748 559 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CLGNO14967 610 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TAPBPO15533 448 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ETHE1O95571 254 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 GABRA1P14867 456 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TNNI3P19429 210 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CD22P20273 847 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 GGT5P36269 586 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 PIGAP37287 484 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNC1P48547 511 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ID2Q02363 134 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MGAT5Q09328 741 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 PIGGQ5H8A4 983 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ARSKQ6UWY0 536 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF793Q6ZN11 406 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 NUBPLQ8TB37 319 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR34Q96EX3 536 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS39Q96JC1 886 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNC2Q96PR1 638 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 F2RL3Q96RI0 385 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 DERL2Q9GZP9 239 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 LIME1Q9H400 295 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 RHOJQ9H4E5 214 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 WWOXQ9NZC7 414 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCA4P78363 2273 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SCELO95171 688 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 KLK2P20151 261 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 PEX19P40855 299 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 KIR2DL3P43628 341 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 HSPA7P48741 367 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL4CP56559 192 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ASPHQ12797 758 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 LAPTM5Q13571 262 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 DOC2AQ14183 400 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CEBPEQ15744 281 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 LYPD8Q6UX82 237 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC35F6Q8N357 371 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX31Q8N9S9 440 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ESAMQ96AP7 390 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms