RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COQ3Q9NZJ6 369 aa18.1■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPT2Q9UMR5 302 aa18.1■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MMACHCQ9Y4U1 282 aa18.1■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM24O75264 130 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERPINB1P30740 379 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTGER1P34995 402 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTGS2P35354 604 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MEOX1P50221 254 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLCN2P51788 898 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHIT1Q13231 466 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TERF2Q15554 542 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBCCQ15814 346 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TECRLQ5HYJ1 363 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C3P1Q6ZMU1 363 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CA13Q8N1Q1 262 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM151AQ8N4L1 468 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACBD4Q8NC06 268 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APCDD1LQ8NCL9 501 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B3GNT7Q8NFL0 401 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C16orf52Q8NHV5 167 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM57AQ8TBR7 257 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CREB3L4Q8TEY5 395 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHTF18Q8WVB6 975 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SDCCAG3Q96C92 435 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF358Q9NW07 568 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa18.09■□□□□ 0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TFECO14948 347 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PEX1O43933 1283 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLK8O60259 260 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDH16O75309 829 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLEC3AO75596 197 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DOC2AQ14183 400 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SETDB1Q15047 1291 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PFKFB4Q16877 469 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM156Q8N614 296 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2W6PQ8NHA6 318 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAL3ST3Q96A11 431 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ESAMQ96AP7 390 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR34Q96EX3 536 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM109Q9BVC6 243 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBK1Q9UHD2 729 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CACNA1CQ13936 2221 aa18.08■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1B0GTH9 108 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYO1DO94832 1006 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLCO1A2P46721 670 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTN3A2P78410 334 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHEXP78562 749 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM211Q6ICI0 200 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED27Q6P2C8 311 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCA5Q86VQ0 697 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEX9Q8N6V9 391 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VMP1Q96GC9 406 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRE2Q9UHX3 823 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXW2Q9UKT8 454 aa18.07■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PPM1 405 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLDN4O14493 209 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HS6ST1O60243 411 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITGA10O75578 1167 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TPOP07202 933 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SBK3P0C264 359 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CASP2P42575 452 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSD17B7P56937 341 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP10-9P60411 292 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TLE4Q04727 773 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RCN2Q14257 317 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CMPK2Q5EBM0 449 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCUBE1Q8IWY4 988 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 REPS1Q96D71 796 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CENPKQ9BS16 269 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ROGDIQ9GZN7 287 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AICDAQ9GZX7 198 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACTR8Q9H981 624 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCCC2Q9HCC0 563 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LGALS13Q9UHV8 139 aa18.06■□□□□ 0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms