RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 MEIOBQ8N635 442 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 YIPF5Q969M3 257 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1024LP59773 190 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0U1RQK1 487 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF320A2RRD8 509 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MATN3O15232 486 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SLC31A1O15431 190 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PI15O43692 258 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PTP4A3O75365 173 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CNTN5O94779 1100 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 STBD1O95210 358 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 LDLRP01130 860 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CYP11A1P05108 521 aa6.06□□□□□ -1.44
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