RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 STX4Q12846 297 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 SLAMF1Q13291 335 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 GGTA1PQ4G0N0 100 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 GFRALQ6UXV0 394 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 CLNKQ7Z7G1 428 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 GPR180Q86V85 440 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 POGLUT1Q8NBL1 392 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 MYRIPQ8NFW9 859 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 TMEM125Q96AQ2 219 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 GPR137Q96N19 417 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 CCDC77Q9BR77 488 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 HES7Q9BYE0 225 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ZBTB26Q9HCK0 441 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ANKRD10Q9NXR5 420 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 XPR1Q9UBH6 696 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 SEC14L3Q9UDX4 400 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ZNF835Q9Y2P0 537 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 A0A0A6YYD5 115 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 RIPK2O43353 540 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 LDB3O75112 727 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 SMIM24O75264 130 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 CLDN1O95832 211 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 IGKV3-11P04433 115 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 RPS17P08708 135 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 CPN2P22792 545 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 GALNSP34059 522 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 CA7P43166 264 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 STT3AP46977 705 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 RAP1GDS1P52306 607 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 KCNK10P57789 538 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 PMP22Q01453 160 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 RBPJQ06330 500 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 TRAF3Q13114 568 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 FRG2Q64ET8 278 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 HSDL2Q6YN16 418 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 OR52B6Q8NGF0 335 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ACMSDQ8TDX5 336 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 PHF21BQ96EK2 531 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 FRG2BQ96QU4 278 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 SERPINI1Q99574 410 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 KLHL1Q9NR64 748 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 MYOTQ9UBF9 498 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 FBXW2Q9UKT8 454 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ATG4BQ9Y4P1 393 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ASB4Q9Y574 426 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 C17orf105B2RV13 164 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 SAP18O00422 153 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ASNA1O43681 348 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 FGF17O60258 216 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 WISP2O76076 250 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ETHE1O95571 254 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 IFNA16P05015 189 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 SSR4P51571 173 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 CCNG1P51959 295 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 RNF4P78317 190 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 TNFRSF17Q02223 184 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 MAPKAPK3Q16644 382 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 MTFR2Q6P444 385 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 NUDT13Q86X67 352 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 RNF175Q8N4F7 328 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 TMEM156Q8N614 296 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 C16orf52Q8NHV5 167 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 SLC2A12Q8TD20 617 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ZNF721Q8TF20 911 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 ATP6V1E2Q96A05 226 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 FBXL20Q96IG2 436 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 SCYL1Q96KG9 808 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-223ENST00000551137 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms