RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 PROCP04070 461 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 KRT15P19012 456 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 CRHR1P34998 444 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 CD96P40200 585 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TAS2R50P59544 299 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TNFRSF17Q02223 184 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 IFT88Q13099 833 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 NR6A1Q15406 480 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 WDR93Q6P2C0 686 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 LGI4Q8N135 537 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 UCN3Q969E3 161 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 NCLNQ969V3 563 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF382Q96SR6 550 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SPACA6W5XKT8 324 aa14.69□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 POLEQ07864 2286 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 BLACEA4D250 179 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 PLIN3O60664 434 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 PRAMEF2O60811 474 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 PDYNP01213 254 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 IFNA16P05015 189 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 NUDT17P0C025 328 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 KRT4P19013 534 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 MLF1P58340 268 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SLC18A2Q05940 514 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 STX4Q12846 297 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SPINK14Q6IE38 97 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 MDS2Q8NDY4 140 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 HBEGFQ99075 208 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 HES7Q9BYE0 225 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 PHF11Q9UIL8 331 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 PTPN13Q12923 2485 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SVILO95425 2214 aa14.68□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TLDC2A0PJX2 215 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 MANBAO00462 879 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 DDAH2O95865 285 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 CLCN2P51788 898 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 FOLH1Q04609 750 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SERTAD2Q14140 314 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 OR1C1Q15619 314 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 NUDT13Q86X67 352 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 METTL4Q8N3J2 472 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 FAR1Q8WVX9 515 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TANKQ92844 425 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 CAVIN3Q969G5 261 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 VMP1Q96GC9 406 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SNX6Q9UNH7 406 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.67□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.66□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.66□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 GLOD5A6NK44 160 aa14.66□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 C17orf105B2RV13 164 aa14.66□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 NEURL1O76050 574 aa14.66□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 AIFM1O95831 613 aa14.66□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 KLK1P06870 262 aa14.66□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 MYL2P10916 166 aa14.66□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SERF1B-208ENST00000515588 CCT5P48643 541 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms