RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 STX4Q12846 297 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 PIGGQ5H8A4 983 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 CES4AQ5XG92 561 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 ADGRD1Q6QNK2 874 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 C7orf57Q8NEG2 295 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 OR5M9Q8NGP3 310 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 TBCDQ9BTW9 1192 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 MS4A8Q9BY19 250 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 SACM1LQ9NTJ5 587 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 WWOXQ9NZC7 414 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 ATG4BQ9Y4P1 393 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 A0A0G2JNJ9 132 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 G3V3Y1 287 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 LDB3O75112 727 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 ETHE1O95571 254 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 CCL3P10147 92 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 CD1DP15813 335 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 HSPA7P48741 367 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 DR1Q01658 176 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 PCDH1Q08174 1060 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 LAPTM5Q13571 262 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 CLYBLQ8N0X4 340 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 ACOT4Q8N9L9 421 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 NUBPLQ8TB37 319 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 UBXN10Q96LJ8 280 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 Q9UFV3 132 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 L3MBTL1Q9Y468 752 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 NCKAP5O14513 1909 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 WDR1O75083 606 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 IGKV3-11P04433 115 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 CELA3AP09093 270 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 DLX5P56178 289 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 OR4D1Q15615 310 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 PDK4Q16654 411 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 FBXO48Q5FWF7 155 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 GPSM1Q86YR5 675 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 CREG2Q8IUH2 290 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 LIX1LQ8IVB5 337 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 SPATA6LQ8N4H0 392 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 ESAMQ96AP7 390 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 CXXC4Q9H2H0 198 aa27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ALYREF-202ENST00000505490 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 HCN1O60741 890 aa27.88■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 DNASE1L1P49184 302 aa27.88■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 ATP6V0D1P61421 351 aa27.88■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF585AQ6P3V2 769 aa27.88■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 LYPD8Q6UX82 237 aa27.88■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 FAM47EQ6ZV65 393 aa27.88■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 CAB39LQ9H9S4 337 aa27.88■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC166P0CW27 439 aa27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 ADH7P40394 386 aa27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 ART1P52961 327 aa27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 SLC10A1Q14973 349 aa27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM35AQ53FP2 167 aa27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 PAGE2BQ5JRK9 111 aa27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 KLHL7Q8IXQ5 586 aa27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 LAS2Q8IYD9 372 aa27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 GPR22Q99680 433 aa27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa27.87■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 PIAS1O75925 651 aa27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 NADKO95544 446 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 P04436 131 aa27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 TNNI3P19429 210 aa27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 STT3AP46977 705 aa27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 CYS1Q717R9 158 aa27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 C9orf40Q8IXQ3 194 aa27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 MYRIPQ8NFW9 859 aa27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 PAQR8Q8TEZ7 354 aa27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 SARAFQ96BY9 339 aa27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 TMUB1Q9BVT8 246 aa27.86■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 FAM221AA4D161 298 aa27.85■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 ZSCAN12O43309 604 aa27.85■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 FGF17O60258 216 aa27.85■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 C1QAP02745 245 aa27.85■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 MAN2A2P49641 1150 aa27.85■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 SLC12A2P55011 1212 aa27.85■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 CHIT1Q13231 466 aa27.85■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 BIKQ13323 160 aa27.85■■■□□ 2.05
ALYREF-202ENST00000505490 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms