RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITPAQ9BY32 194 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHST8Q9H2A9 424 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTG2Q9H4K7 406 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCN5AQ14524 2016 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 METTL15A6NJ78 407 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 E9PQ18 207 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM227AF5H4B4 570 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GFYI3L273 518 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCDH17O14917 1159 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SUV39H1O43463 412 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PEX14O75381 377 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UPK1BO75841 260 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABLIM3O94929 683 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR56A5P0C7T3 313 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 JUPP14923 745 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SERPINA4P29622 427 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NR4A2P43354 598 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BDKRB1P46663 353 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDH12P55289 794 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TLE2Q04725 743 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RGNQ15493 299 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF404Q494X3 552 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRIM60Q495X7 471 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZAR1Q86SH2 424 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ELMOD1Q8N336 334 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR5M11Q96RB7 305 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PITX2Q99697 317 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NRTNQ99748 197 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BRD9Q9H8M2 597 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MARCH7Q9H992 704 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C1orf226A1L170 272 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AGAP5A6NIR3 686 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 A6NL46 340 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLDN24A6NM45 220 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGSF6O95976 241 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CBSLP0DN79 551 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SRFP11831 508 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IDSP22304 550 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRPH2P23942 346 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDHA2P29803 388 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HLA-FP30511 346 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CBSP35520 551 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GGT2P36268 569 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPINT3P49223 89 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HBA1P69905 142 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FADDQ13158 208 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CPTPQ5TA50 214 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 Q6ZVL8 140 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GAREM2Q75VX8 874 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.28□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms