RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491339.1

GABRE-211, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, humanhuman

TSL 2

Gene GABRE, Length 2,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRE-211ENST00000491339 HMX2A2RU54 273 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 H0YIV9 168 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 LRRTM2O43300 516 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 NME2P1O60361 137 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 CTNSO60931 367 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 SH3BGRLO75368 114 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 ZFAND5O76080 213 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 CLDN9O95484 217 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 ZNF24P17028 368 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 TNNI3P19429 210 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 NME2P22392 152 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 CD96P40200 585 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 HLCSP50747 726 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 SSR4P51571 173 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 PMP22Q01453 160 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 TNFRSF17Q02223 184 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 ZNF793Q6ZN11 406 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 NUDT13Q86X67 352 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 MORN4Q8NDC4 146 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 ART5Q96L15 291 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 DGAT2Q96PD7 388 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 NPAS2Q99743 824 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 POLEQ07864 2286 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 RTCAO00442 366 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 CYR61O00622 381 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 ITGA10O75578 1167 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 SP1P08047 785 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 STSP08842 583 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 TAC1P20366 129 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 KCNK10P57789 538 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 IFT88Q13099 833 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 BIKQ13323 160 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 SPINK14Q6IE38 97 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 HSDL2Q6YN16 418 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 LCA5Q86VQ0 697 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 FJX1Q86VR8 437 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 ASB15Q8WXK1 588 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 PHF21BQ96EK2 531 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 FRMD6Q96NE9 622 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 SERPINI1Q99574 410 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 OR51B5Q9H339 312 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.09□□□□□ -1.11
GABRE-211ENST00000491339 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 ASPDHA6ND91 283 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 A8MVJ9 347 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 C17orf105B2RV13 164 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 PLPP1O14494 284 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 MAN1A2O60476 641 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 LDB3O75112 727 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 NEURL1O76050 574 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 SEMA3DO95025 777 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 NR2F6P10588 404 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 SLAMF1Q13291 335 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 CUL3Q13618 768 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.08□□□□□ -1.12
GABRE-211ENST00000491339 GPR180Q86V85 440 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.2 ms