RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478423.6

NPHP4-208, Transcript of nephrocystin 4, human

TSL 2

Gene NPHP4, Length 4,467 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPHP4-208	ENST00000478423	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	UGDH	O60701	494 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	GGT1	P19440	569 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	AOAH	P28039	575 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	SOX9	P48436	509 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ASB11	Q8WXH4	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	FAM3C	Q92520	227 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	HPS1	Q92902	700 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	EGLN2	Q96KS0	407 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	GAL3ST1	Q99999	423 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	NTMT1	Q9BV86	223 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	FBRS	Q9HAH7	460 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	DNASE1L1	P49184	302 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	PON3	Q15166	354 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	CES4A	Q5XG92	561 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	TMEM156	Q8N614	296 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	FES	P07332	822 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	CLDN2	P57739	230 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	HHEX	Q03014	270 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	CD47	Q08722	323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	PIP5K1A	Q99755	562 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ACPT	Q9BZG2	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	KCNJ13	O60928	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	GJA4	P35212	333 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	XKR5	Q6UX68	686 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	EPYC	Q99645	322 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	SOCS2	O14508	198 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	GJA8	P48165	433 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ZNF33B	Q06732	778 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	FEV	Q99581	238 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	RMI1	Q9H9A7	625 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	IFT52	Q9Y366	437 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPHP4-208	ENST00000478423	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	CD72	P21854	359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	RORC	P51449	518 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	ST3GAL4	Q11206	333 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	ANKFN1	Q8N957	763 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	CHST4	Q8NCG5	386 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TRIM63	Q969Q1	353 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TMEM19	Q96HH6	336 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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