RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GPR135Q8IZ08 494 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 EXD3Q8N9H8 876 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PATE1Q8WXA2 126 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TANKQ92844 425 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PPCDCQ96CD2 204 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SMIM10Q96HG1 83 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GBP5Q96PP8 586 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 F2RL3Q96RI0 385 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LYRM4Q9HD34 91 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GMEB1Q9Y692 573 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 A0A096LPI6 279 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 A0A0J9YVX5 310 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 FEZF1A0PJY2 475 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 FITM1A5D6W6 292 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GABRR3A8MPY1 467 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 H0YIG0 161 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CLDN4O14493 209 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MRASO14807 208 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 HAT1O14929 419 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 RASSF9O75901 435 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ITGB2P05107 769 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 IFI6P09912 130 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 COX7A2P14406 83 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ALOX12P18054 663 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SDC1P18827 310 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ME2P23368 584 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PSMB5P28074 263 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SSR2P43308 183 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 NUDT2P50583 147 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 OR1D5P58170 312 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 NCALDP61601 193 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SLAMF1Q13291 335 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 NFYCQ13952 458 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PGS1Q32NB8 556 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LINC00303Q3SY05 128 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 COLEC12Q5KU26 742 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MED25Q71SY5 747 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 D2HGDHQ8N465 521 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MOAP1Q96BY2 351 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC58Q96CX6 371 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MAP3K3Q99759 626 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 THTPAQ9BU02 230 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 C1orf50Q9BV19 199 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 DUSP26Q9BV47 211 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TRIM4Q9C037 500 aa6.65□□□□□ -1.34
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