RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 OLAHQ9NV23 265 aa22.37■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 COL12A1Q99715 3063 aa22.36■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1B0GTL3 188 aa22.36■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.36■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 AGFG2O95081 481 aa22.36■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 NUDT13Q86X67 352 aa22.36■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 OR14A16Q8NHC5 309 aa22.35■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 STT3AP46977 705 aa22.32■■□□□ 1.16
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SMKR1-201ENST00000462322 HLCSP50747 726 aa22.32■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
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