RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 LGSNQ5TDP6 509 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CES4AQ5XG92 561 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CHSY3Q70JA7 882 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CAVIN3Q969G5 261 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2E3Q969T4 207 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 NCLNQ969V3 563 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RGMAQ96B86 450 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CNDP1Q96KN2 507 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNC2Q96PR1 638 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TAAR6Q96RI8 345 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LPAR4Q99677 370 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LYRM4Q9HD34 91 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 STMN3Q9NZ72 180 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB21Q9UL25 225 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TMCO1Q9UM00 188 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMM22Q9Y584 194 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MED12Q93074 2177 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MANBAO00462 879 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNHIT1O43257 154 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GLRA3O75311 464 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 NEURL1O76050 574 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CBX6O95503 412 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CLPSP04118 112 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK1P06870 262 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT17P0C025 328 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CT62P0C5K7 136 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ICAM2P13598 275 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT15P19012 456 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT4P19013 534 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CPN2P22792 545 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 JAK1P23458 1154 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MST1P26927 711 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ARRB2P32121 409 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGER1P34995 402 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CRHR1P34998 444 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 MLF1P58340 268 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ARG2P78540 354 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC13A2Q13183 592 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 TUBA3CQ13748 450 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PCLAFQ15004 111 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RASA2Q15283 850 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 EXT1Q16394 746 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 FRG2Q64ET8 278 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SPINK14Q6IE38 97 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 METTL4Q8N3J2 472 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 BANPQ8N9N5 519 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MDS2Q8NDY4 140 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GRHL3Q8TE85 626 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF721Q8TF20 911 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 AGAP11Q8TF27 550 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.53□□□□□ -1.36
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