RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 NLGN4XQ8N0W4 816 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 GPR32P1Q8NGA4 272 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 DACH2Q96NX9 599 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 NEURL2Q9BR09 285 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.23■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 FEZF1A0PJY2 475 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ZAR1LA6NP61 321 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 PDPK1O15530 556 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 SEMA7AO75326 666 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 MFN2O95140 757 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 CHMP24386 653 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 CXCR2P25025 360 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 LIMK1P53667 647 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 TUBA1BP68363 451 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 REEP5Q00765 189 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ST3GAL4Q11206 333 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 HEPACAMQ14CZ8 416 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 TUBA1AQ71U36 451 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 NATD1Q8N6N6 113 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM19Q96HH6 336 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ASB16Q96NS5 453 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 DSN1Q9H410 356 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 PRSS16Q9NQE7 514 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 MS4A12Q9NXJ0 267 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 C5AR2Q9P296 337 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 HCN2Q9UL51 889 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 DUSP12Q9UNI6 340 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ALPK3Q96L96 1907 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 H7BY64 318 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 PTHP01270 115 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 PORP16435 677 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 HSD17B2P37059 387 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ALDH9A1P49189 494 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 CCR8P51685 355 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 FRMPD2BQ6IN97 320 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 STX19Q8N4C7 294 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 BADQ92934 168 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 RAB7BQ96AH8 199 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ANKHQ9HCJ1 492 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 DSPPQ9NZW4 1301 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 DENND4AQ7Z401 1863 aa15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM247A6NEH6 219 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 TMPRSS11DO60235 418 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 PCCBP05166 539 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ADRA2AP08913 450 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 CDH3P22223 829 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 CRISP1P54107 249 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 COLEC12Q5KU26 742 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 C6orf120Q7Z4R8 191 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 PSMA8Q8TAA3 256 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ENOPH1Q9UHY7 261 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 IGLON5A6NGN9 336 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 FAM227AF5H4B4 570 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 CDC42P60953 191 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 FBXO43Q4G163 708 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 MCFD2Q8NI22 146 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 SMPDL3AQ92484 453 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 SUSD6Q92537 303 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 RAB8BQ92930 207 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 NT5DC2Q9H857 520 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa15.21■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 METTL15A6NJ78 407 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 C5orf58C9J3I9 102 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 HMGN4O00479 90 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 RPN2P04844 631 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 TGM1P22735 817 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 DRD3P35462 400 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 CRISP3P54108 245 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 HSPB3Q12988 150 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 PCBD2Q9H0N5 130 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 KRBA1A5PL33 1030 aa15.2■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 EPHX1P07099 455 aa15.2■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 SERPINB1P30740 379 aa15.2■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 TAS2R38P59533 333 aa15.2■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF404Q494X3 552 aa15.2■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 NUDT13Q86X67 352 aa15.2■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 AMER3Q8N944 861 aa15.2■□□□□ 0.02
SHQ1-202ENST00000444040 UCN3Q969E3 161 aa15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms