RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNG1Q06432 222 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMPKQ09013 629 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABRQ12979 859 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERV3-1Q14264 604 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEMA3AQ14563 771 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OASLQ15646 514 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB109BQ30KR1 87 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00303Q3SY05 128 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCL7AQ4VC05 210 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCTD11Q693B1 232 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 AFTPHQ6ULP2 937 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CES3Q6UWW8 571 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 C16orf89Q6UX73 402 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RANBP10Q6VN20 620 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSTA5Q7RTV2 222 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS42Q7Z5A4 293 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX20Q7Z614 316 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM126BQ8IUX1 230 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT222Q8N1A0 295 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXD3Q8N9H8 876 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4E2Q8NGC2 313 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR52E1Q8NGJ3 308 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5AR1Q8NGP9 310 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2L2Q8NH16 312 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCN9Q8WX39 176 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELMO1Q92556 727 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM63Q969Q1 353 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ULK4Q96C45 1275 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED8Q96G25 268 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTL8Q9H568 366 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 HRASLS2Q9NWW9 162 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF17Q9P2E2 1029 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ESPL1Q14674 2120 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 EML6Q6ZMW3 1958 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC189A1A4V9 331 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 H0Y3Z8 333 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8MH3BSY2 632 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTN3A3O00478 584 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP104O60308 925 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPFIA2O75334 1257 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPAG6O75602 509 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCRG1O75711 98 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAS8O95995 478 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FSHBP01225 129 aa4.24□□□□□ -1.73
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RPS3AP54-201ENST00000435535 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSD3B1P14060 373 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST6GAL1P15907 406 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 NELFEP18615 380 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCN2P20062 427 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP2A7P20853 494 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMB5P28074 263 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 BDKRB1P46663 353 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNJ1P48048 391 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCT5P48643 541 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXL2P58012 376 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH17Q12864 832 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKAA1Q13131 559 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPS2Q13227 327 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAPSNQ13702 412 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS6KA1Q15418 735 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PARP6Q2NL67 630 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM153CQ494X1 144 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf189Q5VU69 101 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACSM6Q6P461 480 aa4.24□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
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