RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLOD2O00469 737 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STAMBPO95630 424 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADRA2CP18825 462 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCGF2P35227 344 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAG2P55895 527 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHRNB3Q05901 458 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GUSBP1Q15486 140 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAA35Q5VZE5 725 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATC1Q76KD6 591 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDSS2Q86YH6 399 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 S100PBPQ96BU1 408 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTBPQ96DY7 904 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DOHHQ9BU89 302 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKHQ9HCJ1 492 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PALMDQ9NP74 551 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1W2PPV9 198 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLPXO76031 633 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FSHBP01225 129 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPIPA8P0DM63 369 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAAP10253 952 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPN3P26045 913 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CMPK1P30085 196 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SERPINB6P35237 376 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GCKP35557 465 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GSCP56915 257 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BTG2P78543 158 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCNIQ14094 377 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIANPQ8IYJ0 282 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RADILQ96JH8 1075 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP28Q96RU2 1077 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COPS8Q99627 209 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRMOQ9BU70 441 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIP5K1CO60331 668 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NDST3O95803 873 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAOAP21397 527 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEMA3AQ14563 771 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 P2RY6Q15077 328 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAB1Q15750 504 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF425Q6IV72 752 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSDL2Q6YN16 418 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC22A20A6NK97 555 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF5CO60282 957 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NDUFA7O95182 113 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPN2P04844 631 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FABP6P51161 128 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PKP1Q13835 747 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BMPR2Q13873 1038 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DOC2AQ14183 400 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF544Q6NX49 715 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C16orf87Q6PH81 154 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR51F2Q8NH61 342 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATL1Q8WXF7 558 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSD17B8Q92506 261 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPA33Q99795 319 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZWILCHQ9H900 591 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PKP3Q9Y446 797 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms