RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SLC41A2Q96JW4 573 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf74Q96LT6 269 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEB18Q96M61 343 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP57Q96MR6 1250 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD27Q96NW4 1050 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM51Q9BSJ1 452 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 OSBPL8Q9BZF1 889 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 DPH5Q9H2P9 285 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 KCNK6Q9Y257 313 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 MARCKSL1P49006 195 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 CCDC110Q8TBZ0 833 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 RSC1A1Q92681 617 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 UCK2Q9BZX2 261 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SLC12A4Q9UP95 1085 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SNX10Q9Y5X0 201 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 HIVEP2P31629 2446 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0G2JK05 382 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN11A1L157 253 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PDZK1P1A8MUH7 402 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SOCS2O14508 198 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 GRAP2O75791 330 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 CAPN1P07384 714 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRK-211ENST00000429595 KRT5P13647 590 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 FPR3P25089 353 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEA4P43358 317 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TNFSF10P50591 281 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ITGA8P53708 1063 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TPTEP56180 551 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SNX16P57768 344 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 BCL2L1Q07817 233 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 RALGDSQ12967 914 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TAF5Q15542 800 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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