RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427722.2

RFX3-AS1-202, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 1,088 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RASAL1O95294 804 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CBX6O95503 412 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ETHE1O95571 254 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OTCP00480 354 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SHBGP04278 402 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SBK3P0C264 359 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RNF224P0DH78 156 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CD96P40200 585 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CLCN2P51788 898 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CDH13P55290 713 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TNFRSF17Q02223 184 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 STX4Q12846 297 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 IFT88Q13099 833 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SLAMF1Q13291 335 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SGO1Q5FBB7 561 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZNF766Q5HY98 468 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FAM219BQ5XKK7 198 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FRG2Q64ET8 278 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SPINK14Q6IE38 97 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MDS2Q8NDY4 140 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 WDR20Q8TBZ3 569 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RGMAQ96B86 450 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 VMP1Q96GC9 406 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FRG2BQ96QU4 278 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 HES7Q9BYE0 225 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 KCMF1Q9P0J7 381 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FETUBQ9UGM5 382 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PHF11Q9UIL8 331 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 LRRK2Q5S007 2527 aa8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RELNP78509 3460 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 A0A0A6YYD5 115 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 A0A1B0GTL3 188 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 C17orf105B2RV13 164 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PPP6CO00743 305 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FCHO1O14526 889 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TMPRSS11DO60235 418 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FGF17O60258 216 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SLC25A12O75746 678 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SEMA3DO95025 777 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 GBAP04062 536 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NR2F6P10588 404 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 EDN3P14138 238 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TNNI3P19429 210 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TAC1P20366 129 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TNFRSF8P28908 595 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 KCNK10P57789 538 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MLF1P58340 268 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 HERVK_113P63132 956 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PLIN5Q00G26 463 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CUL3Q13618 768 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SERTAD2Q14140 314 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 GGTA1PQ4G0N0 100 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 C18orf63Q68DL7 685 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 GPR180Q86V85 440 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NUDT13Q86X67 352 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OR4N5Q8IXE1 308 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OR14A16Q8NHC5 309 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TRPC4APQ8TEL6 797 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MZB1Q8WU39 189 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NR4A3Q92570 626 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TMEM237Q96Q45 408 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 HBEGFQ99075 208 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SERPINI1Q99574 410 aa8.59□□□□□ -1.03
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CCDC77Q9BR77 488 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms