RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNA2P20248 432 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTHP32929 405 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XCR1P46094 333 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PROX2Q3B8N5 592 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF793Q6ZN11 406 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C6orf120Q7Z4R8 191 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UCN3Q969E3 161 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPH7Q9BTV6 452 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCN3BQ9NY72 215 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R7Q9NYW3 318 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVK-18Q9QC07 812 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYO10Q9HD67 2058 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 J3KTA2 159 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RECKO95980 971 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STATHP02808 62 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCHEP06276 602 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRK3P35626 688 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZIC1Q15915 447 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MICAQ29983 383 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPDYE7PQ495Y7 208 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM35AQ53FP2 167 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR153Q6NV75 609 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTSS1LQ765P7 747 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LGI4Q8N135 537 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXL6Q8N531 539 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2L3Q8NG85 312 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMA8Q8TAA3 256 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIPOR3Q96MK2 946 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIP5K1AQ99755 562 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL31Q9H511 634 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RASSF1Q9NS23 344 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RLIMQ9NVW2 624 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS38A1L453 326 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C5orf58C9J3I9 102 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAT1O14929 419 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGA12O60330 932 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INMTO95050 263 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANXA8P13928 327 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DRD2P14416 443 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GP2P55259 537 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABATP80404 500 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HYAL2Q12891 473 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFATC3Q12968 1075 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MLC1Q15049 377 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUSP7Q16829 419 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENTHD1Q8IYW4 607 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAR1Q8WVX9 515 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE2FQ969M7 185 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FKBP10Q96AY3 582 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM19Q96HH6 336 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNC2Q96PR1 638 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPHK1Q9NYA1 384 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENPP4Q9Y6X5 453 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F5P12259 2224 aa17.76■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POM121BA6NF01 834 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C4orf51C9J302 202 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WBP4O75554 376 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TFPTP0C1Z6 253 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD247P20963 164 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT20P35900 424 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STT3AP46977 705 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIMS1P48059 325 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PXNP49023 591 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPTX1Q15818 432 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADPRMQ3LIE5 342 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF605Q86T29 641 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APH1BQ8WW43 257 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB8BQ92930 207 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2M4Q96R27 311 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MACROD1Q9BQ69 325 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHNO1Q9BSD3 238 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FUNDC2Q9BWH2 189 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACER3Q9NUN7 267 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMGN4O00479 90 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFNW1P05000 195 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTR1BP28222 390 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD6P30203 668 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCT3P49368 545 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN2P57739 230 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TP53BP2Q13625 1128 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTR4Q13639 388 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM145Q8NBT3 493 aa17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.8 ms