RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 P2RX3P56373 397 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PLA1AQ53H76 456 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 THEM5Q8N1Q8 247 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM145Q8NBT3 493 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC32Q9BV29 185 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R9Q9NYW1 312 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PPV9 198 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPRSS11DO60235 418 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IGSF6O95976 241 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TM4SF4P48230 202 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRLHRP49683 370 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKCZQ05513 592 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSM1Q08AH1 577 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FCHO2Q0JRZ9 810 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SHISA5Q8N114 240 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PDZD8Q8NEN9 1154 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZG16BQ96DA0 208 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SCMH1Q96GD3 660 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EBPLQ9BY08 206 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 WASHC1A8K0Z3 465 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IL9P15248 144 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP11P24347 488 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A1P30531 599 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1E2P47887 323 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP2Q05923 314 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TNK1Q13470 666 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK10Q15131 360 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C22orf39Q6P5X5 142 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 WASH2PQ6VEQ5 465 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HEATR4Q86WZ0 1026 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKK1Q8NFD2 765 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR11H4Q8NGC9 324 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR151Q8TDV0 419 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MYLIPQ8WY64 445 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM129BQ96TA1 746 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF426Q9BUY5 554 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCG8Q9H221 673 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EPHX3Q9H6B9 360 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRSQ13332 1948 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PS29 197 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCRL2O00421 344 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGN4O00479 90 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR37L1O60883 481 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CSO75390 466 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TLE2Q04725 743 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 P2RY14Q15391 338 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC8DQ7L1W4 858 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TCTE3Q8IZS6 198 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM169Q96HH4 297 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 COQ10AQ96MF6 247 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 APOL4Q9BPW4 351 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52A5Q9H2C5 316 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP64Q9NPA5 681 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL15Q9NXU5 204 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL26Q9Y258 94 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DENND4AQ7Z401 1863 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SNPHO15079 494 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IL1AP01583 271 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SPTBP11277 2137 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ITPKAP23677 461 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP1P29972 269 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HNMTP50135 292 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF7Q14155 803 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf183Q5T699 404 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKS3Q6ZW76 656 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AMER2Q8N7J2 671 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNC2Q96PR1 638 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS35Q96QK1 796 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AP5M1Q9H0R1 490 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MTG2Q9H4K7 406 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.44□□□□□ -1.86
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