RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 VRK3Q8IV63 474 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 LILRA2Q8N149 483 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR2M7Q8NG81 312 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SMPDL3BQ92485 455 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SGCZQ96LD1 299 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 NPAS2Q99743 824 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 JAM3Q9BX67 310 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TMEM184CQ9NVA4 438 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 URADA6NGE7 173 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SLC16A5O15375 505 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 AKR1B10O60218 316 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 B4GALT2O60909 372 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 APOC2P02655 101 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TMEM253P0C7T8 217 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CNR1P21554 472 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 DMTNQ08495 405 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 GRB7Q14451 532 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PARP6Q2NL67 630 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ABHD13Q7L211 337 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PHC2Q8IXK0 858 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 LINC01560Q8TB33 94 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SLC13A3Q8WWT9 602 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SLCO2A1Q92959 643 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PERPQ96FX8 193 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 VMP1Q96GC9 406 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 A0A1B0GVC2 190 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 A0A1W2PPV9 198 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR2W5A6NFC9 320 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 IQCF5A8MTL0 148 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 E5RI56 91 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ZBTB14O43829 449 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RDH16O75452 317 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 IGHG3P01860 377 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TPM1P09493 284 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RBP3P10745 1247 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FOXN2P32314 431 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 GCKP35557 465 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TIMP3P35625 211 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RHAGQ02094 409 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RGS1Q08116 209 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TRIM14Q14142 442 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SLC18A3Q16572 532 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ZNF425Q6IV72 752 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SCIMPQ6UWF3 145 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RTL4Q6ZR62 310 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MDGA2Q7Z553 956 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ASPGQ86U10 573 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SLC26A11Q86WA9 606 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 LACC1Q8IV20 430 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 KRT222Q8N1A0 295 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TSLPQ969D9 159 aa7.27□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FBXW5Q969U6 566 aa7.27□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms