RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 UBALD1Q8TB05 177 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 CD99L2Q8TCZ2 262 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 TNFRSF14Q92956 283 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM159Q96B96 161 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 TBC1D20Q96BZ9 403 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 C12orf42Q96LP6 360 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
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RNU6-540P-201ENST00000384622 MUC13Q9H3R2 512 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 NECTIN3Q9NQS3 549 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 WDR35Q9P2L0 1181 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 STK39Q9UEW8 545 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 ERVW-1Q9UQF0 538 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP-1.24□□□□□ -2.61
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RNU6-540P-201ENST00000384622 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 STRCQ7RTU9 1775 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 TSPOAP1O95153 1857 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 UTRNP46939 3433 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 USF3Q68DE3 2245 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 LAMB1P07942 1786 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A0D9SG42 100 aa-1.25□□□□□ -2.61
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RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1W2PPB8 328 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1W2PPM1 405 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1W2PRS3 328 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 FSD2A1L4K1 749 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 A6NDX4 124 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 KIR3DP1A8MWS1 328 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 SAP18O00422 153 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 E2F3O00716 465 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 KIF5CO60282 957 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 SERF1AO75920 110 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 DDHD2O94830 711 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 FSTL3O95633 263 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 CD4P01730 458 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 MMP1P03956 469 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 PRLRP16471 622 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 NPR2P20594 1047 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 CPT2P23786 658 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 FCARP24071 287 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 PAX6P26367 422 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 TNFSF9P41273 254 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 TM4SF4P48230 202 aa-1.25□□□□□ -2.61
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RNU6-540P-201ENST00000384622 SPAG11BQ08648 103 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 CDC16Q13042 620 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 VEZF1Q14119 521 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 ABRAXAS2Q15018 415 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 RPS6KA2Q15349 733 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 PTPN14Q15678 1187 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
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RNU6-540P-201ENST00000384622 TRIM60Q495X7 471 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 GALNTL6Q49A17 601 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 SPATA46Q5T0L3 261 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF880Q6PDB4 577 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 IL34Q6ZMJ4 242 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 CYHR1Q6ZMK1 362 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 RASGRP2Q7LDG7 609 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 KRT74Q7RTS7 529 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 MFSD6LQ8IWD5 586 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 FTMTQ8N4E7 242 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF283Q8N7M2 679 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 Q8N9W7 124 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC38A9Q8NBW4 561 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 CATSPER1Q8NEC5 780 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 CFAP61Q8NHU2 1237 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 RLN3Q8WXF3 142 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 JDP2Q8WYK2 163 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 HTRA1Q92743 480 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 RORBQ92753 470 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 NABP1Q96AH0 204 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 PTERQ96BW5 349 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 S1PR5Q9H228 398 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM60Q9H2L4 133 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 COG4Q9H9E3 785 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 JMJD4Q9H9V9 463 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 ADAP2Q9NPF8 381 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-540P-201ENST00000384622 SNTG1Q9NSN8 517 aa-1.25□□□□□ -2.61
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