RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 KCNK12Q9HB15 430 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 IL23AQ9NPF7 189 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 CD9P21926 228 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 CRISP3P54108 245 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 SP140Q13342 867 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 TLR4O00206 839 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 SEMA3DO95025 777 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 ABATP80404 500 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 C1orf61Q13536 156 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.72□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 A0A1W2PQU0 124 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 ADAM23O75077 832 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 SEC14L2O76054 403 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 TIMP1P01033 207 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 OR12D1P0DN82 309 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 MPIP34949 423 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 CLCN7P51798 805 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 XKP51811 444 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 SMU1Q2TAY7 513 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 HTR3DQ70Z44 454 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 B3GALT4O96024 378 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 ZNF45Q02386 682 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 MZT2AQ6P582 158 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 SBF2Q86WG5 1849 aa14.71□□□□□ -0.05
FGD1-201ENST00000375135 SLITRK5O94991 958 aa14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 SBSNQ6UWP8 590 aa14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 COX18Q8N8Q8 333 aa14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 SLC22A4Q9H015 551 aa14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.71□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 A8MUA0 341 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 B4DGG1 531 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 KMOO15229 486 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 OR5F1O95221 314 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 FHP07954 510 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 SKP1P63208 163 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 LIPIQ6XZB0 460 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 MCUBQ9NWR8 336 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 OR7A17O14581 309 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 UPK1BO75841 260 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 OR6A2O95222 327 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 LATS1O95835 1130 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 TIMP2P16035 220 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 CD72P21854 359 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 CEP68Q76N32 757 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 ING4Q9UNL4 249 aa14.7□□□□□ -0.06
FGD1-201ENST00000375135 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms