RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 ADAP2Q9NPF8 381 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 WWOXQ9NZC7 414 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 IKBKGQ9Y6K9 419 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SPACA6W5XKT8 324 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 TACC2O95359 2948 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 DCHS2Q6V1P9 2916 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 LRRC14BA6NHZ5 514 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 FIGNL2A6NMB9 653 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CLGNO14967 610 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ERI3O43414 337 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 STK16O75716 305 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SMIM10L1P0DMW3 83 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 RFC3P40938 356 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 GPR85P60893 370 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 STX4Q12846 297 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ACAP2Q15057 778 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CDSNQ15517 529 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 FAM83EQ2M2I3 478 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 HSDL2Q6YN16 418 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SPNS3Q6ZMD2 512 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CCDC91Q7Z6B0 441 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 TCAIMQ8N3R3 496 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 APCDD1LQ8NCL9 501 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 PSD4Q8NDX1 1056 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 RHEBL1Q8TAI7 183 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SMIM10Q96HG1 83 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ZNF559Q9BR84 538 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CD244Q9BZW8 370 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ROGDIQ9GZN7 287 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 DNAJC11Q9NVH1 559 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 KCMF1Q9P0J7 381 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CCDC168Q8NDH2 2452 aa13.07□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 OR14I1A6ND48 311 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SUPT3HB4E1H0 165 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ADAM10O14672 748 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 BCKDKO14874 412 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 DYRK3O43781 588 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 DNAJB6O75190 326 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SUPT3HO75486 399 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 PDE9AO76083 593 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 TNNI3P19429 210 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CD22P20273 847 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CNTFP26441 200 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 PPIAP62937 165 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CMPK2Q5EBM0 449 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 TECRLQ5HYJ1 363 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 TIFABQ6ZNK6 161 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 TMEM200AQ86VY9 491 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SCUBE1Q8IWY4 988 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 TMEM151AQ8N4L1 468 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 OR5L2Q8NGL0 311 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 OR14A16Q8NHC5 309 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 MZB1Q8WU39 189 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SERINC2Q96SA4 455 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 AICDAQ9GZX7 198 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 KLHL31Q9H511 634 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 GPRC5BQ9NZH0 403 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 NUDT4Q9NZJ9 180 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 COPS7AQ9UBW8 275 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 EDARQ9UNE0 448 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 FBN2P35556 2912 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 DNAJC13O75165 2243 aa13.06□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ZNHIT1O43257 154 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 KLK8O60259 260 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CLEC3AO75596 197 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 OR2J2O76002 312 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 S100BP04271 92 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SBK3P0C264 359 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 COX7A2P14406 83 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 MTTPP55157 894 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 MYBPHQ13203 477 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SERTAD2Q14140 314 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 DOC2AQ14183 400 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 PFKFB4Q16877 469 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 PAGE2BQ5JRK9 111 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ADNP2Q6IQ32 1131 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 IL20RBQ6UXL0 311 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 RTL4Q6ZR62 310 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 MDGA2Q7Z553 956 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 FGD2Q7Z6J4 655 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ZNF227Q86WZ6 799 aa13.05□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms