RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ABHD17BQ5VST6 288 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 SCIMPQ6UWF3 145 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 COMMD6Q7Z4G1 85 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 BEST3Q8N1M1 668 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 METTL4Q8N3J2 472 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 METTL6Q8TCB7 284 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 CPT1CQ8TCG5 803 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 MIB2Q96AX9 1013 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 MID1IP1Q9NPA3 183 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 PHF11Q9UIL8 331 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 SPACA6W5XKT8 324 aa25.21■■□□□ 1.63
TPGS1-201ENST00000359315 FASNP49327 2511 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP10A1A4S6 786 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 GLOD5A6NK44 160 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 PROM1O43490 865 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ESRRBO95718 433 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 KLK1P06870 262 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 HMOX2P30519 316 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 PKNOX1P55347 436 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 STX4Q12846 297 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ACER2Q5QJU3 275 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 CYP20A1Q6UW02 462 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 C19orf60Q96EN9 201 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ZIM3Q96PE6 472 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 MECRQ9BV79 373 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ACPTQ9BZG2 426 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ADAP2Q9NPF8 381 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 NTNG1Q9Y2I2 539 aa25.2■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 SCN2AQ99250 2005 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PS29 197 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 IFNA16P05015 189 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 GPR143P51810 404 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 LIPMQ5VYY2 423 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 IQCKQ8N0W5 287 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 B3GNT7Q8NFL0 401 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 TCP10LQ8TDR4 215 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 BRF2Q9HAW0 419 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 MS4A12Q9NXJ0 267 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 STMN3Q9NZ72 180 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 STK38LQ9Y2H1 464 aa25.19■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 DYTNA2CJ06 578 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 KRT6AP02538 564 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 KRT6BP04259 564 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ENO1P06733 434 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 NR2F6P10588 404 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ALDH3A1P30838 453 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 KRT6CP48668 564 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 TNFSF10P50591 281 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 HMGCS1Q01581 520 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 FOLH1Q04609 750 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 TERF2Q15554 542 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 MMP21Q8N119 569 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF321PQ8N8H1 164 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 DOK4Q8TEW6 326 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 HAS2Q92819 552 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 NCLNQ969V3 563 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD10Q9NXR5 420 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 VTI1BQ9UEU0 232 aa25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 WISP1O95388 367 aa25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 TUBBP07437 444 aa25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 SERPINB3P29508 390 aa25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 TLR1Q15399 786 aa25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP157Q5JU67 520 aa25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF354BQ96LW1 612 aa25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 SMC6Q96SB8 1091 aa25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 RNF32Q9H0A6 362 aa25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 CDCP1Q9H5V8 836 aa25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 MID2Q9UJV3 735 aa25.17■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 BLACEA4D250 179 aa25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 OR5H15A6NDH6 313 aa25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 PGRMC2O15173 223 aa25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 TYROBPO43914 113 aa25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 ULK1O75385 1050 aa25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 TAS2R50P59544 299 aa25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 SERTAD2Q14140 314 aa25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 MEP1AQ16819 746 aa25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 CEP85LQ5SZL2 805 aa25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa25.16■■□□□ 1.62
TPGS1-201ENST00000359315 SLC5A8Q8N695 610 aa25.16■■□□□ 1.62
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