RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 MED27Q6P2C8 311 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ISCA2Q86U28 154 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 FBF1Q8TES7 1133 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 OR51B5Q9H339 312 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 LYRM4Q9HD34 91 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 OPTCQ9UBM4 332 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 K7EPI3 171 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 FGF17O60258 216 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ETHE1O95571 254 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TNNI3P19429 210 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 STX2P32856 288 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 KRTAP10-9P60411 292 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 RNF4P78317 190 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PLGLB1Q02325 96 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 E2F2Q14209 437 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 GRTP1Q5TC63 336 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 LAS2Q8IYD9 372 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MORN4Q8NDC4 146 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 OR7G3Q8NG95 312 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 SCYL1Q96KG9 808 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.69□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ESYT3A0FGR9 886 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 HRKO00198 91 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 SCELO95171 688 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 GSTA2P09210 222 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CCL3P10147 92 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CPN2P22792 545 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CASP2P42575 452 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MAGEA4P43358 317 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 EMC4Q5J8M3 183 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 EID3Q8N140 333 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TEX9Q8N6V9 391 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 DOK4Q8TEW6 326 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 NXNL1Q96CM4 212 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 SPACA6W5XKT8 324 aa14.68□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ACOT7O00154 380 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PLPP1O14494 284 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CELA3AP09093 270 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MTHFD2P13995 350 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MAGEA5P43359 124 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 DNASE1L1P49184 302 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 RAP1GDS1P52306 607 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TNFRSF17Q02223 184 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 SERTAD2Q14140 314 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 RTL4Q6ZR62 310 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CYS1Q717R9 158 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF721Q8TF20 911 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 UBE2E3Q969T4 207 aa14.67□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms