RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 MLIPQ5VWP3 458 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ERAP2Q6P179 960 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PNCKQ6P2M8 343 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DEF8Q6ZN54 512 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TUBA1AQ71U36 451 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 AKAP14Q86UN6 197 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ATCAYQ86WG3 371 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LAS2Q8IYD9 372 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 AMER3Q8N944 861 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SLC35B4Q969S0 331 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 NXPE3Q969Y0 559 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 REPS1Q96D71 796 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DTD2Q96FN9 168 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 OPALINQ96PE5 141 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 RAD9AQ99638 391 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SGPP1Q9BX95 441 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 RERGLQ9H628 205 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CLN6Q9NWW5 311 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TSPAN11A1L157 253 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 H3BN98 237 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TLR4O00206 839 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TAF4O00268 1085 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 AP3D1O14617 1153 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HAT1O14929 419 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PPM1DO15297 605 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 OR10H3O60404 316 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 IFNW1P05000 195 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ITGA2P17301 1181 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 NNMTP40261 264 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 GPR1P46091 355 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LIMK1P53667 647 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 RBBP4Q09028 425 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CDC20Q12834 499 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DSG2Q14126 1118 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 E2F2Q14209 437 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF77Q15935 545 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SLC34A3Q8N130 599 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ARRDC3Q96B67 414 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 COQ10AQ96MF6 247 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 NLNQ9BYT8 704 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SP140LQ9H930 580 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HHATLQ9HCP6 504 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 EHD3Q9NZN3 535 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TAC3Q9UHF0 121 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ASF1AQ9Y294 204 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 A6NL46 340 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 C5orf58C9J3I9 102 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ANHXE9PGG2 379 aa6.91□□□□□ -1.3
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