RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000052462.12

Pdpk1-201, Transcript of 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdpk1, Length 1,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Rhox9Q9EQM5 227 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cd320Q9Z1P5 260 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Vmn1r90A0A087WR36 309 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Spats1A2RRY8 269 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 ChadlE9Q7T7 748 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gm340F6RGI3 1242 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Prr22F6TNE3 422 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ppt2O35448 302 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Slc6a11P31650 627 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 AcadvlP50544 656 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Faf1P54731 649 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 NadkP58058 439 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Rab8bP61028 207 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ikzf1Q03267 517 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gdf9Q07105 441 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Xrcc1Q60596 631 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ei24Q61070 340 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Il17aQ62386 158 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ift52Q62559 426 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Bhlhb9Q6PB60 539 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 D11Wsu47eQ6PIX9 558 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Pgs1Q8BHF7 553 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Fastkd3Q8BSN9 661 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gucy1b2Q8BXH3 824 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Tmem106aQ8VC04 261 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Clec14aQ8VCP9 459 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr330Q8VGD9 315 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cd209eQ91ZW7 208 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gins4Q99LZ3 223 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cops7aQ9CZ04 275 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Tomm70Q9CZW5 611 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Tex22Q9D9U4 189 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Apbb2Q9DBR4 760 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Il23aQ9EQ14 196 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Htr3bQ9JHJ5 437 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ninj2Q9JL89 143 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Hs6st1Q9QYK5 411 aa14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Dock4P59764 1978 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cyp4a32A2A8T1 509 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Vmn2r18E9Q280 788 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gm7945F6QI24 236 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Fbxw9F8VPX2 458 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Spin2eJ3QNQ0 234 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Rdh5O55240 318 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Klk1P15947 261 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 NelfeP19426 375 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Hoxd11P23813 323 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Il1r2P27931 410 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 AcadmP45952 421 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Kcnab3P97382 249 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr629Q0VBH3 314 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ulk3Q3U3Q1 472 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Fcho2Q3UQN2 809 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Clca4bQ3UW98 925 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Trim75Q3UWZ0 467 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gm906Q3V0M1 1017 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Sema3gQ4LFA9 780 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 RflnbQ5SVD0 216 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Catsper3Q80W99 395 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Yipf4Q8C407 246 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Colec12Q8K4Q8 742 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cdt1Q8R4E9 557 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 HpgdQ8VCC1 269 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Rab7bQ8VEA8 199 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Eif3mQ99JX4 374 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Fis1Q9CQ92 152 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ribc2Q9D4Q1 309 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Prl8a8Q9DAS4 241 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Med27Q9DB40 311 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Psma4Q9R1P0 261 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 RerglB2RVE2 204 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Vmn2r97K7N6Z2 861 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Vmn2r93L7N1Z9 857 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Slc6a6O35316 621 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 P01629 112 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Rps15aP62245 130 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 EvlP70429 414 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Dhrs11Q3U0B3 260 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Nkx6-3Q3UHX8 262 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Sorbs2Q3UTJ2 1180 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 C1orf109Q499E6 217 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Rbbp4Q60972 425 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ifit3Q64345 403 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Rps9Q6ZWN5 194 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Zfp101Q8BP18 612 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Eri3Q8C460 337 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Erich5Q8K0S2 362 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ugt2b34Q8K154 532 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 SdslQ8R238 329 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr599Q8VG01 315 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Pcdhb20Q91XZ9 799 aa14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 LsrQ99KG5 594 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26 ms