RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cts7Q91ZF2 331 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MINDY3Q9CV28 444 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trmt11Q9CWH5 460 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mgat4cQ9D306 478 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam3bQ9D309 235 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 UqcrbQ9D855 111 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Jph1Q9ET80 660 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Xlr4bQ9JJQ7 215 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gmeb1Q9JL60 562 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Decr2Q9WV68 292 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm2237E9Q501 211 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc27a6E9Q9W4 619 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3591K7N6X2 186 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 C1dO35473 141 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ctla2bP12400 113 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abcb1aP21447 1276 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nr2f6P43136 390 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usp30Q3UN04 517 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dag1Q62165 893 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nox3Q672J9 568 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Polr2mQ6P6I6 366 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc6a5Q761V0 799 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1140Q7TR39 311 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr366Q7TRY4 309 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam72aQ8BFZ8 149 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ssuh2Q8C3L1 340 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trmt6Q8CE96 497 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CtbsQ8R242 366 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r203Q8R273 311 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tspan10Q8VCF5 331 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acot7Q91V12 381 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc13a3Q91Y63 600 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q922M7 232 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 WacQ924H7 646 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TriobpQ99KW3 2014 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rassf1Q99MK9 340 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Raf1Q99N57 648 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q9CQF4 240 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trappc2Q9CQP2 140 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppil3Q9D6L8 161 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 EefsecQ9JHW4 583 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B4galt4Q9JJ04 344 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ca5bQ9QZA0 317 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 M1apQ9Z0E1 529 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stpg3A2RSX4 306 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc9a5B2RXE2 898 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cilp2D3Z7H8 1162 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr414E9Q5P8 317 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adh6aE9Q5Z6 375 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il13ra1O09030 424 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab23P35288 237 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TshrP47750 764 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pdx1P52946 284 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gabrr2P56476 465 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btg1P62325 171 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CpeQ00493 476 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MuskQ61006 868 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cox8aQ64445 69 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alg8Q6P8H8 526 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tas2r140Q7TQA4 312 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Galnt7Q80VA0 657 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dlec1Q8BLA1 635 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dpep2Q8C255 478 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxl3Q8C4V4 428 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnfaip8l1Q8K288 186 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atat1Q8K341 421 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc56Q8K375 552 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 St7lQ8K4P7 559 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igsf8Q8R366 611 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr692Q8VF03 329 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plpp3Q99JY8 312 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf687Q9D2D7 1237 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pbld1Q9DCG6 288 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sphk2Q9JIA7 617 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PolkQ9QUG2 852 aa9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc9a6A1L3P4 702 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Xpnpep2B1AVD1 674 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm7951E9Q0A2 213 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm17555F6U8B9 371 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6482F6YHC1 213 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm17124F6ZIG1 213 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3327F7C9A1 213 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1700014D04RikJ3QMS2 983 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r117K7N6V1 857 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ifi203O35368 408 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc32a1O35633 525 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01636 108 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GlrbP48168 496 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adra2aQ01338 450 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TepsinQ3U3N6 573 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dcp1bQ3U564 578 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spata48Q5NC83 441 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Orm1Q60590 207 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Laptm4aQ60961 233 aa9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.6 ms